Development of microsatellite loci and population genetics in the bumblebee catfish species Pseudopimelodus atricaudus and Pseudopimelodus magnus (Siluriformes: Pseudopimelodidae)
Neotrop. ichthyol
; 19(1): e200053, 2021. tab, graf
Article
em En
| VETINDEX
| ID: vti-31506
Biblioteca responsável:
BR68.1
Localização: BR68.1
ABSTRACT
The Neotropical freshwater catfish Pseudopimelodus atricaudus and Pseudopimelodus magnus are two recently discovered species endemic to the Colombian Magdalena-Cauca River basin. In this study, a set of 13 microsatellite loci were developed by using next generation sequence technology to assess the genetic diversity and population structure in P. atricaudus and test for cross-species amplification in P. magnus. Both species exhibited high genetic diversity (P. atricaudus Na 9.000 - 9.769 alleles/locus, Ho 0.760 - 0.804, HE 0.804 - 0.840; P. magnus Na 12.8 - 5.4 alleles/locus, Ho 0.638 - 0.683, HE 0.747 - 0.755) compared to the mean levels of genetic diversity reported for Neotropical Siluriformes, and lack of genetic differentiation among sampling sites within the Cauca River (P. atricaudus F'ST=0.013 - 0.017, P > 0.05, D'est= -0.004 - 0.023, P > 0.05; P. magnus F'ST= 0.031, P= 0.055; D'est= 0.045, P= 0.058). This work is the first insight on the diversity and the population genetics of species of the family Pseudopimelodidae and provides a framework to further population genetic and conservation analyses needed in this poorly studied family at the microevolutionary level.(AU)
RESUMEN
Los bagres neotropicales Pseudopimelodus atricaudus y Pseudopimelodus magnus son dos especies recientemente descubiertas, endémicas de la cuenca Magdalena-Cauca en Colombia. En este estudio, se desarrollaron 13 loci microsatélites usando tecnología de secuenciación de próxima generación para evaluar la diversidad genética y la estructura poblacional de P. atricaudus y evaluar su amplificación cruzada en P. magnus. Ambas especies exhibieron altos valores de diversidad genética (P. atricaudus Na 9.000 - 9.769 alelos/locus, HO 0.760 - 0.804, HE 0.804 - 0.840; P. magnus Na 12.8 - 5.4 alelos/locus, HO 0.638 - 0.683, HE 0.747 - 0.755) comparados con los valores promedios de diversidad genética reportados para Siluriformes neotropicales, y ausencia de estructura genética entre los sitios analizados (P. atricaudus F'ST= 0.013 - 0.017, P > 0.05, D'est= -0.004 - 0.023, P > 0.05; P. magnus F'ST= 0.031, P= 0.055; D'est= 0.045, P= 0.058). Este trabajo representa la primera aproximación a la diversidad y genética poblacional de especies de la familia Pseudopimelodidae y proporciona un marco de referencia para futuros estudios genético-poblacionales y de conservación, requeridos en esta familia de bagres poco estudiada en el nivel microevolutivo.(AU)
Palavras-chave
Texto completo:
1
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VETINDEX
Assunto principal:
Variação Genética
/
Peixes-Gato
/
Repetições de Microssatélites
/
Genética Populacional
Limite:
Animals
Idioma:
En
Revista:
Neotrop. ichthyol
Ano de publicação:
2021
Tipo de documento:
Article