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Satellitome analysis on the pale-breasted thrush Turdus leucomelas (Passeriformes; Turdidae) uncovers the putative co-evolution of sex chromosomes and satellite DNAs.
Souza, Guilherme Mota; Kretschmer, Rafael; Toma, Gustavo Akira; de Oliveira, Alan Moura; Deon, Geize Aparecida; Setti, Princia Grejo; Zeni Dos Santos, Rodrigo; Goes, Caio Augusto Gomes; Del Valle Garnero, Analía; Gunski, Ricardo José; de Oliveira, Edivaldo Herculano Correa; Porto-Foresti, Fabio; Liehr, Thomas; Utsunomia, Ricardo; de Bello Cioffi, Marcelo.
Afiliação
  • Souza GM; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, 13565-905, Brazil.
  • Kretschmer R; Departamento de Ecologia, Zoologia e Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, RS, 96010-610, Brazil.
  • Toma GA; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, 13565-905, Brazil.
  • de Oliveira AM; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, 13565-905, Brazil.
  • Deon GA; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, 13565-905, Brazil.
  • Setti PG; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, SP, 13565-905, Brazil.
  • Zeni Dos Santos R; Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru, SP, 17033-360, Brazil.
  • Goes CAG; Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru, SP, 17033-360, Brazil.
  • Del Valle Garnero A; Universidade Federal do Pampa, Campus São Gabriel, São Gabriel, RS, 97307-020, Brazil.
  • Gunski RJ; Universidade Federal do Pampa, Campus São Gabriel, São Gabriel, RS, 97307-020, Brazil.
  • de Oliveira EHC; Seção de Meio Ambiente, Instituto Evandro Chagas, Ananindeua, PA, 67030-000, Brazil.
  • Porto-Foresti F; Instituto de Ciências Exatas e Naturais, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, 66075-110, Brazil.
  • Liehr T; Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru, SP, 17033-360, Brazil.
  • Utsunomia R; Institut für Humangenetik, Universitätsklinikum Jena, Friedrich-Schiller Universität, 07747, Jena, Germany. thomas.liehr@med.uni-jena.de.
  • de Bello Cioffi M; Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru, SP, 17033-360, Brazil.
Sci Rep ; 14(1): 20656, 2024 09 04.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-39232109
ABSTRACT
Do all birds' sex chromosomes follow the same canonical one-way direction of evolution? We combined cytogenetic and genomic approaches to analyze the process of the W chromosomal differentiation in two selected Passeriform species, named the Pale-breasted Thrush Turdus leucomelas and the Rufous-bellied thrush T. rufiventris. We characterized the full catalog of satellite DNAs (satellitome) of T. leucomelas, and the 10 TleSatDNA classes obtained together with 16 microsatellite motifs were in situ mapped in both species. Additionally, using Comparative Genomic Hybridization (CGH) assays, we investigated their intragenomic variations. The W chromosomes of both species did not accumulate higher amounts of both heterochromatin and repetitive sequences. However, while T. leucomelas showed a heterochromatin-poor W chromosome with a very complex evolutionary history, T. rufiventris showed a small and partially heterochromatic W chromosome that represents a differentiated version of its original autosomal complement (Z chromosome). The combined approach of CGH and sequential satDNA mapping suggest the occurrence of a former W-autosomal translocation event in T. leucomelas, which had an impact on the W chromosome in terms of sequence gains and losses. At the same time, an autosome, which is present in both males and females in a polymorphic state, lost sequences and integrated previously W-specific ones. This putative W-autosomal translocation, however, did not result in the emergence of a multiple-sex chromosome system. Instead, the generation of a neo-W chromosome suggests an unexpected evolutionary trajectory that deviates from the standard canonical model of sex chromosome evolution.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Cromossomos Sexuais / DNA Satélite / Heterocromatina / Evolução Molecular Limite: Animals Idioma: En Revista: Sci Rep Ano de publicação: 2024 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Reino Unido
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Cromossomos Sexuais / DNA Satélite / Heterocromatina / Evolução Molecular Limite: Animals Idioma: En Revista: Sci Rep Ano de publicação: 2024 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Reino Unido