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Genomic study of Acinetobacter baumannii strains co-harboring bla OXA-58 and bla NDM-1 reveals a large multidrug-resistant plasmid encoding these carbapenemases in Brazil.
Rodrigues, Daiana Cristina Silva; Silveira, Melise Chaves; Pribul, Bruno Rocha; Karam, Bruna Ribeiro Sued; Picão, Renata Cristina; Kraychete, Gabriela Bergiante; Pereira, Felicidade Mota; de Lima, Rildo Mendes; de Souza, Antonio Kleber Gomes; Leão, Robson Souza; Marques, Elizabeth Andrade; Rocha-de-Souza, Cláudio Marcos; Carvalho-Assef, Ana Paula D'Alincourt.
Afiliação
  • Rodrigues DCS; Laboratório de Bacteriologia Aplicada à Saúde Única e Resistência Antimicrobiana (LabSUR), Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Silveira MC; Laboratório de Bacteriologia Aplicada à Saúde Única e Resistência Antimicrobiana (LabSUR), Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Pribul BR; Laboratório de Bacteriologia Aplicada à Saúde Única e Resistência Antimicrobiana (LabSUR), Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Karam BRS; Laboratório de Bacteriologia Aplicada à Saúde Única e Resistência Antimicrobiana (LabSUR), Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Picão RC; Laboratório de Investigação em Microbiologia Médica (LIMM), Instituto de Microbiologia Paulo de Góes (IMPG), Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Kraychete GB; Laboratório de Investigação em Microbiologia Médica (LIMM), Instituto de Microbiologia Paulo de Góes (IMPG), Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Pereira FM; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia (LACEN-BA), Bahia, Brazil.
  • de Lima RM; Laboratório Central de Saúde Pública da Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas (LACEN-AM/FVS-RCP), Amazonas, Brazil.
  • de Souza AKG; Laboratório Reunidos Ltda., Amazonas, Brazil.
  • Leão RS; Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia (DMIP), Faculdade de Ciências Médicas (FCM), Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Marques EA; Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia (DMIP), Faculdade de Ciências Médicas (FCM), Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Rocha-de-Souza CM; Laboratório de Bacteriologia Aplicada à Saúde Única e Resistência Antimicrobiana (LabSUR), Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro, Brazil.
  • Carvalho-Assef APD; Laboratório de Bacteriologia Aplicada à Saúde Única e Resistência Antimicrobiana (LabSUR), Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro, Brazil.
Front Microbiol ; 15: 1439373, 2024.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-39086650
ABSTRACT

Introduction:

Acinetobacter baumannii contributes significantly to the global issue of multidrug-resistant (MDR) nosocomial infections. Often, these strains demonstrate resistance to carbapenems (MDR-CRAB), the first-line treatment for infections instigated by MDR A. baumannii. Our study focused on the antimicrobial susceptibility and genomic sequences related to plasmids from 12 clinical isolates of A. baumannii that carry both the blaOXA-58 and bla NDM-1 carbapenemase genes.

Methods:

Whole-genome sequencing with long-read technology was employed for the characterization of an A. baumannii plasmid that harbors the bla OXA-58 and blaNDM-1 genes. The location of the bla OXA-58 and bla NDM-1 genes was confirmed through Southern blot hybridization assays. Antimicrobial susceptibility tests were conducted, and molecular characterization was performed using PCR and PFGE.

Results:

Multilocus Sequence Typing analysis revealed considerable genetic diversity among bla OXA-58 and bla NDM-1 positive strains in Brazil. It was confirmed that these genes were located on a plasmid larger than 300 kb in isolates from the same hospital, which also carry other antimicrobial resistance genes. Different genetic contexts were observed for the co-occurrence of these carbapenemase-encoding genes in Brazilian strains.

Discussion:

The propagation of bla OXA-58 and bla NDM-1 genes on the same plasmid, which also carries other resistance determinants, could potentially lead to the emergence of bacterial strains resistant to multiple classes of antimicrobials. Therefore, the characterization of these strains is of paramount importance for monitoring resistance evolution, curbing their rapid global dissemination, averting outbreaks, and optimizing therapy.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Front Microbiol Ano de publicação: 2024 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Suíça
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