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Exploring SoySNP50K and USDA Germplasm Collection Data to Find New QTLs Associated with Protein and Oil Content in Brazilian Genotypes.
Silva, Jessica Nayara Basílio; Bueno, Rafael Delmond; de Sousa, Teresinha de Jesus Feitosa; Xavier, Yan Pablo Moreira; Silva, Luiz Claudio Costa; Piovesan, Newton Deniz; Ribeiro, Cleberson; Dal-Bianco, Maximiller.
Afiliação
  • Silva JNB; Laboratório de Bioquímica Genética de Plantas, BIOAGRO, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, 21236570-900, Brazil.
  • Bueno RD; Laboratório de Bioquímica Genética de Plantas, BIOAGRO, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, 21236570-900, Brazil.
  • de Sousa TJF; Laboratório de Bioquímica Genética de Plantas, BIOAGRO, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, 21236570-900, Brazil.
  • Xavier YPM; Laboratório de Bioquímica Genética de Plantas, BIOAGRO, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, 21236570-900, Brazil.
  • Silva LCC; Departamento de Ciências Biológicas, Universidade Estadual de Feira de Santana, Feira de Santana, BA, 44036-900, Brazil.
  • Piovesan ND; Laboratório de Bioquímica Genética de Plantas, BIOAGRO, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, 21236570-900, Brazil.
  • Ribeiro C; Departamento de Biologia Geral, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, 36570-900, Brazil.
  • Dal-Bianco M; Laboratório de Bioquímica Genética de Plantas, BIOAGRO, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, MG, 21236570-900, Brazil. maximiller@ufv.br.
Biochem Genet ; 2024 Feb 15.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-38358588
ABSTRACT
Genetic diversity within a germplasm collection plays a vital role in the success of breeding programs. However, comprehending this diversity and identifying accessions with desirable traits pose significant challenges. This study utilized publicly available data to investigate SNP markers associated with protein and oil content in Brazilian soybeans. Through this research, twenty-two new QTLs (Quantitative Trait Loci) were identified, and we highlighted the substantial influence of Roanoke, Lee and Bragg ancestor on the genetic makeup of Brazilian soybean varieties. Our findings demonstrate that certain markers are being lost in modern cultivars, while others maintain or even increase their frequency. These observations indicate genomic regions that have undergone selection during soybean introduction in Brazil and could be valuable in breeding programs aimed at enhancing protein or oil content.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Biochem Genet Ano de publicação: 2024 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos
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