Inference of differentially expressed genes using generalized linear mixed models in a pairwise fashion.

Terra Machado, Douglas; Bernardes Brustolini, Otávio José; Côrtes Martins, Yasmmin; Grivet Mattoso Maia, Marco Antonio; Ribeiro de Vasconcelos, Ana Tereza

Terra Machado, Douglas; Bernardes Brustolini, Otávio José; Côrtes Martins, Yasmmin; Grivet Mattoso Maia, Marco Antonio; Ribeiro de Vasconcelos, Ana Tereza.

Afiliação

Terra Machado D; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Rio de Janeiro, Brazil.
Bernardes Brustolini OJ; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Rio de Janeiro, Brazil.
Côrtes Martins Y; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Rio de Janeiro, Brazil.
Grivet Mattoso Maia MA; Centro de Estudo em Telecomunicações, Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Ribeiro de Vasconcelos AT; Laboratório de Bioinformática, Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, Rio de Janeiro, Brazil.

PeerJ ; 11: e15145, 2023.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-37033732

Assuntos

Perfilação da Expressão Gênica; Transcriptoma; Humanos; Modelos Lineares; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Transcriptoma/genética; Biologia Computacional/métodos

Palavras-chave

DEGRE package; Differentially expressed genes; Gene dispersion; Generalized linear mixed model; Preprocessing; Random effects

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Perfilação da Expressão Gênica / Transcriptoma Limite: Humans Idioma: En Revista: PeerJ Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos

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