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A Comprehensive Picture of the Structures, Energies, and Bonding in the Alanine Dimers.
David, Jorge; Gómez, Sara; Guerra, Doris; Guerra, Dario; Restrepo, Albeiro.
Afiliação
  • David J; Escuela de Ciencias, Departamento de Ciencias Físicas, Universidad Eafit, AA 3300, Medellín, Colombia.
  • Gómez S; Scuola Normale Superiore, Classe di Scienze, Piazza dei Cavalieri 7, 56126, Pisa, Italy.
  • Guerra D; Instituto de Química, Universidad de Antioquia UdeA, Calle 70 No. 52-21, Medellín, Colombia.
  • Guerra D; Departamento de Educación y Ciencias Básicas, Instituto Tecnológico Metropolitano, Calle 73 No. 76 A-354, Medellín, Colombia.
  • Restrepo A; Instituto de Química, Universidad de Antioquia UdeA, Calle 70 No. 52-21, Medellín, Colombia.
Chemphyschem ; 22(23): 2401-2412, 2021 12 03.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34554628
High level quantum mechanical computations and extensive stochastic searches of the potential energy surfaces of the Alanine dimers uncover rich and complex structural and interaction landscapes. A total of 416 strongly bound (up 13.4 kcal mol-1 binding energies at the DLPNO-CCSD(T)/6-311++G(d,p) level corrected by the basis set superposition error and by the zero point vibrational energies over B3LYP-D3 geometries), close energy equilibrium structures were located, bonded via 32 specific types of intermolecular contacts including Y⋅⋅⋅H-X primary and Y⋅⋅⋅H-C secondary hydrogen bonds, H⋅⋅⋅H dihydrogen contacts, and non conventional anti-electrostatic Y δ-⋯ X δ- interactions. The putative global minimum is triply degenerate, corresponding to the structure of the common dimer of a carboxylic acid. All quantum descriptors of chemical bonding point to a multitude of weak individual interactions within each dimer, whose cumulative effect results in large binding energies and in an attractive fluxional wall of non-covalent interactions in the interstitial region between the monomers.
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Idioma: En Revista: Chemphyschem Assunto da revista: BIOFISICA / QUIMICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Colômbia País de publicação: Alemanha

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Idioma: En Revista: Chemphyschem Assunto da revista: BIOFISICA / QUIMICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Colômbia País de publicação: Alemanha