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First Description of a Satellite DNA in Manatees' Centromeric Regions.
Valeri, Mirela Pelizaro; Dias, Guilherme Borges; do Espírito Santo, Alice Alves; Moreira, Camila Nascimento; Yonenaga-Yassuda, Yatiyo; Sommer, Iara Braga; Kuhn, Gustavo C S; Svartman, Marta.
Afiliação
  • Valeri MP; Laboratório de Citogenômica Evolutiva, Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil.
  • Dias GB; Department of Genetics and Institute of Bioinformatics, University of Georgia, Athens, GA, United States.
  • do Espírito Santo AA; Laboratório de Citogenômica Evolutiva, Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil.
  • Moreira CN; Departamento de Genética e Biologia Evolutiva, Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Yonenaga-Yassuda Y; Departamento de Genética e Biologia Evolutiva, Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.
  • Sommer IB; Centro Nacional de Pesquisa e Conservação da Biodiversidade Marinha do Nordeste, Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade, Brasília, Brazil.
  • Kuhn GCS; Laboratório de Citogenômica Evolutiva, Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil.
  • Svartman M; Laboratório de Citogenômica Evolutiva, Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Brazil.
Front Genet ; 12: 694866, 2021.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34504514
Trichechus manatus and Trichechus inunguis are the two Sirenia species that occur in the Americas. Despite their increasing extinction risk, many aspects of their biology remain understudied, including the repetitive DNA fraction of their genomes. Here we used the sequenced genome of T. manatus and TAREAN to identify satellite DNAs (satDNAs) in this species. We report the first description of TMAsat, a satDNA comprising ~0.87% of the genome, with ~684bp monomers and centromeric localization. In T. inunguis, TMAsat showed similar monomer length, chromosome localization and conserved CENP-B box-like motifs as in T. manatus. We also detected this satDNA in the Dugong dugon and in the now extinct Hydrodamalis gigas genomes. The neighbor-joining tree shows that TMAsat sequences from T. manatus, T. inunguis, D. dugon, and H. gigas lack species-specific clusters, which disagrees with the predictions of concerted evolution. We detected a divergent TMAsat-like homologous sequence in elephants and hyraxes, but not in other mammals, suggesting this sequence was already present in the common ancestor of Paenungulata, and later became a satDNA in the Sirenians. This is the first description of a centromeric satDNA in manatees and will facilitate the inclusion of Sirenia in future studies of centromeres and satDNA biology.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Front Genet Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Suíça
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