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Genome sequence of Bradyrhizobium yuanmingense strain P10 130, a highly efficient nitrogen-fixing bacterium that could be used for Desmodium incanum inoculation.
Toniutti, María Antonieta; Albicoro, Francisco Javier; Castellani, Lucas Gabriel; López García, Silvina Laura; Fornasero, Laura Viviana; Zuber, Nicolás Emilio; Vera, Leda Mailén; Vacca, Carolina; Cafiero, Juan Hilario; Winkler, Anika; Kalinowski, Jörn; Lagares, Antonio; Torres Tejerizo, Gonzalo Arturo; Del Papa, María Florencia.
Afiliação
  • Toniutti MA; Facultad de Ciencias Agrarias, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina.
  • Albicoro FJ; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina.
  • Castellani LG; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina.
  • López García SL; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina.
  • Fornasero LV; Facultad de Ciencias Agrarias, Universidad Nacional del Litoral, Santa Fe, Argentina.
  • Zuber NE; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina.
  • Vera LM; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina.
  • Vacca C; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina.
  • Cafiero JH; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina.
  • Winkler A; CeBiTec - Centrum für Biotechnologie, Universität Bielefeld, Bielefeld, Germany.
  • Kalinowski J; CeBiTec - Centrum für Biotechnologie, Universität Bielefeld, Bielefeld, Germany.
  • Lagares A; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina.
  • Torres Tejerizo GA; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina. Electronic address: gatt@biol.unlp.edu.ar.
  • Del Papa MF; IBBM - Instituto de Biotecnología y Biología Molecular, CONICET - Departamento de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Exactas, Universidad Nacional de La Plata, Calles 47 y 115 (1900) La Plata, Argentina. Electronic address: floppy@biol.unlp.edu.ar.
Gene ; 768: 145267, 2021 Feb 05.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33122079
Strain P10 130, an isolated Bradyrhizobium strain from Argentina which promotes the growth of the leguminous plant Desmodium incanum by different mechanisms was previously selected as the best candidate for D. incanum inoculation based on broader selective criteria. A close relationship between this strain and B. yuanmingense was determined by MALDI BioTyper identification and 16S rRNA gene phylogenetic analysis. This study aimed to analyse the genome sequence of B. yuanmingense P10 130 in order to deepen our knowledge regarding its plant growth-promoting traits and to establish its phylogenetic relationship with other species of Bradyrhizobium genus. The genome size of strain P10 130 was estimated to be 7.54 Mb that consisted of 65 contigs. Genome Average Nucleotide Identity (ANI) analysis revealed that B. yuanmingense CCBAU 10071 T was the closest strain to P10 130 with ca. 96% identity. Further analysis of the genome of B. yuanmingense P10 130 identified 20 nod/nol/NOE, 14 nif/18 fix, 5 nap/5 nor genes, which may be potentially involved in nodulation, nitrogen fixation, and denitrification process respectively. Genome sequence of B. yuanmingense P10 130 is a valuable source of information to continue the research of its potential industrial production as a biofertilizer of D. incanum.
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Bacteriano / Bradyrhizobium / Fabaceae / Fixação de Nitrogênio Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Gene Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Argentina País de publicação: Holanda

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Bacteriano / Bradyrhizobium / Fabaceae / Fixação de Nitrogênio Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Gene Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Argentina País de publicação: Holanda