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Characterization of a SPM-1 metallo-beta-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa by comparative genomics and phenotypic analysis.
do Nascimento, Ana Paula Barbosa; Medeiros Filho, Fernando; Pauer, Heidi; Antunes, Luis Caetano Martha; Sousa, Hério; Senger, Hermes; Albano, Rodolpho Mattos; Trindade Dos Santos, Marcelo; Carvalho-Assef, Ana Paula D'Alincourt; da Silva, Fabrício Alves Barbosa.
Afiliação
  • do Nascimento APB; Programa de Computação Científica, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 21040-360, Brazil. ana.pbn@gmail.com.
  • Medeiros Filho F; Programa de Computação Científica, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 21040-360, Brazil.
  • Pauer H; Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 21040-361, Brazil.
  • Antunes LCM; Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 21040-361, Brazil.
  • Sousa H; Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 21041-210, Brazil.
  • Senger H; Departamento de Computação, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 13565-905, Brazil.
  • Albano RM; Departamento de Computação, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 13565-905, Brazil.
  • Trindade Dos Santos M; Departamento de Bioquímica, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 21941-909, Brazil.
  • Carvalho-Assef APD; Laboratório Nacional de Computação Científica, Petrópolis, 25651-075, Brazil.
  • da Silva FAB; Laboratório de Pesquisa em Infecção Hospitalar, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 21040-360, Brazil.
Sci Rep ; 10(1): 13192, 2020 08 06.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32764694
Pseudomonas aeruginosa is one of the most common pathogens related to healthcare-associated infections. The Brazilian isolate, named CCBH4851, is a multidrug-resistant clone belonging to the sequence type 277. The antimicrobial resistance mechanisms of the CCBH4851 strain are associated with the presence of the bla[Formula: see text] gene, encoding a metallo-beta-lactamase, in combination with other exogenously acquired genes. Whole-genome sequencing studies focusing on emerging pathogens are essential to identify key features of their physiology that may lead to the identification of new targets for therapy. Using both Illumina and PacBio sequencing data, we obtained a single contig representing the CCBH4851 genome with annotated features that were consistent with data reported for the species. However, comparative analysis with other Pseudomonas aeruginosa strains revealed genomic differences regarding virulence factors and regulatory proteins. In addition, we performed phenotypic assays that revealed CCBH4851 is impaired in bacterial motilities and biofilm formation. On the other hand, CCBH4851 genome contained acquired genomic islands that carry transcriptional factors, virulence and antimicrobial resistance-related genes. Presence of single nucleotide polymorphisms in the core genome, mainly those located in resistance-associated genes, suggests that these mutations may also influence the multidrug-resistant behavior of CCBH4851. Overall, characterization of Pseudomonas aeruginosa CCBH4851 complete genome revealed the presence of features that strongly relates to the virulence and antibiotic resistance profile of this important infectious agent.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fenótipo / Pseudomonas aeruginosa / Beta-Lactamases / Genômica Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Sci Rep Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Reino Unido
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Fenótipo / Pseudomonas aeruginosa / Beta-Lactamases / Genômica Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Sci Rep Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Reino Unido