CRISPRcasIdentifier: Machine learning for accurate identification and classification of CRISPR-Cas systems.

Padilha, Victor A; Alkhnbashi, Omer S; Shah, Shiraz A; de Carvalho, André C P L F; Backofen, Rolf

Padilha, Victor A; Alkhnbashi, Omer S; Shah, Shiraz A; de Carvalho, André C P L F; Backofen, Rolf.

Afiliação

Padilha VA; Institute of Mathematics and Computer Sciences, University of São Paulo, Av. Trabalhador São Carlense 400, São Carlos, SP, 13566-590, Brazil.
Alkhnbashi OS; Bioinformatics Group, University of Freiburg, Georges-Köhler-Allee 106, 79110 Freiburg, Germany.
Shah SA; COPSAC, Copenhagen University Hospitals Herlev and Gentofte, Ledreborg Alle 34, DK-2820 Gentofte, Denmark.
de Carvalho ACPLF; Institute of Mathematics and Computer Sciences, University of São Paulo, Av. Trabalhador São Carlense 400, São Carlos, SP, 13566-590, Brazil.
Backofen R; Bioinformatics Group, University of Freiburg, Georges-Köhler-Allee 106, 79110 Freiburg, Germany.

Gigascience ; 9(6)2020 06 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32556168

Assuntos

Sistemas CRISPR-Cas; Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas; Biologia Computacional/métodos; Genômica/métodos; Algoritmos; Archaea/genética; Bactérias/genética; Genoma Arqueal; Genoma Bacteriano; Aprendizado de Máquina; Fluxo de Trabalho

Palavras-chave

CRISPR-Cas; Cas genes; Cas proteins; machine learning

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Biologia Computacional / Genômica / Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas / Sistemas CRISPR-Cas Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: Gigascience Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos

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