Your browser doesn't support javascript.
loading
Homology Modeling of Protein Targets with MODELLER.
Bitencourt-Ferreira, Gabriela; de Azevedo, Walter Filgueira.
Afiliação
  • Bitencourt-Ferreira G; Escola de Ciências da Saúde, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul-PUCRS, Porto Alegre, RS, Brazil.
  • de Azevedo WF; Escola de Ciências da Saúde, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul-PUCRS, Porto Alegre, RS, Brazil. walter@azevedolab.net.
Methods Mol Biol ; 2053: 231-249, 2019.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31452109
Homology modeling is a computational approach to generate three-dimensional structures of protein targets when experimental data about similar proteins are available. Although experimental methods such as X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance spectroscopy successfully solved the structures of nearly 150,000 macromolecules, there is still a gap in our structural knowledge. We can fulfill this gap with computational methodologies. Our goal in this chapter is to explain how to perform homology modeling of protein targets for drug development. We choose as a homology modeling tool the program MODELLER. To illustrate its use, we describe how to model the structure of human cyclin-dependent kinase 3 using MODELLER. We explain the modeling procedure of CDK3 apoenzyme and the structure of this enzyme in complex with roscovitine.
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Proteínas / Simulação de Dinâmica Molecular / Simulação de Acoplamento Molecular Limite: Humans Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Proteínas / Simulação de Dinâmica Molecular / Simulação de Acoplamento Molecular Limite: Humans Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos