Your browser doesn't support javascript.
loading
Cross-genera SSR transferability in cacti revealed by a case study using Cereus (Cereeae, Cactaceae).
Bombonato, Juliana Rodrigues; Bonatelli, Isabel Aparecida Silva; Silva, Gislaine Angélica Rodrigues; Moraes, Evandro Marsola; Zappi, Daniela Cristina; Taylor, Nigel P; Franco, Fernando Faria.
Afiliação
  • Bombonato JR; Departamento de Biologia, Centro de Ciências Humanas e Biológicas, Universidade Federal de São Carlos, Sorocaba, SP, Brazil.
  • Bonatelli IAS; Programa de Pós-graduação em Biologia Comparada, Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP, Brazil.
  • Silva GAR; Departamento de Biologia, Centro de Ciências Humanas e Biológicas, Universidade Federal de São Carlos, Sorocaba, SP, Brazil.
  • Moraes EM; Departamento de Biologia, Centro de Ciências Humanas e Biológicas, Universidade Federal de São Carlos, Sorocaba, SP, Brazil.
  • Zappi DC; Departamento de Biologia, Centro de Ciências Humanas e Biológicas, Universidade Federal de São Carlos, Sorocaba, SP, Brazil.
  • Taylor NP; Instituto Tecnológico Vale, Museu Paraense Emilio Goeldi, Coord. Botânica, Belém, PA, Brazil.
  • Franco FF; Singapore Botanic Gardens (National Parks Board), Singapore, Republic of Singapore.
Genet Mol Biol ; 42(1): 87-94, 2019.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30794719
The study of transferability of simple sequence repeats (SSR) among closely related species is a well-known strategy in population genetics, however transferability among distinct genera is less common. We tested cross-genera SSR amplification in the family Cactaceae using a total of 20 heterologous primers previously developed for the genera Ariocarpus, Echinocactus, Polaskia and Pilosocereus, in four taxa of the genus Cereus: C. fernambucensis subsp. fernambucensis, C. fernambucensis subsp. sericifer, C. jamacaru and C. insularis. Nine microsatellite loci were amplified in Cereus resulting in 35.2% of success in transferability, which is higher than the average rate of 10% reported in the literature for cross-genera transferability in eudicots. The genetic variation in the transferred markers was sufficient to perform standard clustering analysis, indicating each population as a cohesive genetic cluster. Overall, the amount of genetic variation found indicates that the transferred SSR markers might be useful in large-scale population studies within the genus Cereus.
Texto completo
Adicionar na Minha BVS
Imprimir
XML
PubMed Links
Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Idioma: En Revista: Genet Mol Biol Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Brasil
Texto completo
Adicionar na Minha BVS
Imprimir
XML
PubMed Links
Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Idioma: En Revista: Genet Mol Biol Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Brasil