Orthosteric and benzodiazepine cavities of the &#945;1ß2Î³2 GABAA receptor: insights from experimentally validated in silico methods.

Amundarain, María Julia; Viso, Juan Francisco; Zamarreño, Fernando; Giorgetti, Alejandro; Costabel, Marcelo

Orthosteric and benzodiazepine cavities of the α₁ß₂Î³₂ GABA_A receptor: insights from experimentally validated in silico methods.

Amundarain, María Julia; Viso, Juan Francisco; Zamarreño, Fernando; Giorgetti, Alejandro; Costabel, Marcelo.

Afiliação

Amundarain MJ; a Departamento de Física, Instituto de Física del Sur (IFISUR) , Universidad Nacional del Sur (UNS), CONICET , Bahía Blanca , Argentina.
Viso JF; a Departamento de Física, Instituto de Física del Sur (IFISUR) , Universidad Nacional del Sur (UNS), CONICET , Bahía Blanca , Argentina.
Zamarreño F; a Departamento de Física, Instituto de Física del Sur (IFISUR) , Universidad Nacional del Sur (UNS), CONICET , Bahía Blanca , Argentina.
Giorgetti A; b Faculty of Mathematical, Physical and Natural Sciences, Department of Biotechnology , University of Verona , Verona , Italy.
Costabel M; c Computational Biomedicine, Institute for Advanced Simulation IAS-5 and Computational Biomedicine, Institute of Neuroscience and Medicine INM-9 , Forschungszentrum Jülich , Jülich , Germany.

J Biomol Struct Dyn ; 37(6): 1597-1615, 2019 Apr.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29633901

Assuntos

Benzodiazepinas/química; Antagonistas de Receptores de GABA-A/química; Simulação de Acoplamento Molecular; Simulação de Dinâmica Molecular; Receptores de GABA-A/química; Sequência de Aminoácidos; Benzodiazepinas/farmacologia; Sítios de Ligação; Descoberta de Drogas/métodos; Antagonistas de Receptores de GABA-A/farmacologia; Ligação de Hidrogênio; Ligantes; Reprodutibilidade dos Testes; Relação Estrutura-Atividade

Palavras-chave

AChBP Acetylcholine Binding Protein; BZDs Benzodiazepines; CNS Central Nervous System; ECD Extracellular domain; ELIC Erwinia ligand-gated ion channel; GABA Gamma-Aminobutyric acid; GABAAR; GABAARs Gamma-Aminobutyric Acid type A receptors; GLIC Gloeobacter ligand-gated ion channel; MD Molecular Dynamics; POPC 1-palmitoyl-2-oleoyl-phophatidylcholine; SCAM Substituted cysteine accessibility method; TMD Transmembrane domain; benzodiazepines; docking; homology modelling; i-BZDs Imidazo-Benzodiazepines; molecular dynamics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Benzodiazepinas / Receptores de GABA-A / Simulação de Dinâmica Molecular / Antagonistas de Receptores de GABA-A / Simulação de Acoplamento Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Biomol Struct Dyn Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Argentina País de publicação: Reino Unido

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