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Clonal expansion across the seas as seen through CPLP-TB database: A joint effort in cataloguing Mycobacterium tuberculosis genetic diversity in Portuguese-speaking countries.
Perdigão, João; Silva, Carla; Diniz, Jaciara; Pereira, Catarina; Machado, Diana; Ramos, Jorge; Silva, Hugo; Abilleira, Fernanda; Brum, Clarice; Reis, Ana J; Macedo, Maíra; Scaini, João L; Silva, Ana B; Esteves, Leonardo; Macedo, Rita; Maltez, Fernando; Clemente, Sofia; Coelho, Elizabeth; Viegas, Sofia; Rabna, Paulo; Rodrigues, Amabélia; Taveira, Nuno; Jordao, Luísa; Kritski, Afrânio; Lapa E Silva, José R; Mokrousov, Igor; Couvin, David; Rastogi, Nalin; Couto, Isabel; Pain, Arnab; McNerney, Ruth; Clark, Taane G; von Groll, Andrea; Dalla-Costa, Elis R; Rossetti, Maria Lúcia; Silva, Pedro E A; Viveiros, Miguel; Portugal, Isabel.
Afiliação
  • Perdigão J; iMed.ULisboa - Instituto de Investigação do Medicamento, Faculdade de Farmácia, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal. Electronic address: jperdigao@ff.ulisboa.pt.
  • Silva C; iMed.ULisboa - Instituto de Investigação do Medicamento, Faculdade de Farmácia, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal.
  • Diniz J; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Pereira C; iMed.ULisboa - Instituto de Investigação do Medicamento, Faculdade de Farmácia, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal.
  • Machado D; Unidade de Microbiologia Médica, Global Health and Tropical Medicine, GHTM, Instituto de Higiene e Medicina Tropical, IHMT, Universidade Nova de Lisboa, UNL, Lisboa, Portugal.
  • Ramos J; Unidade de Microbiologia Médica, Global Health and Tropical Medicine, GHTM, Instituto de Higiene e Medicina Tropical, IHMT, Universidade Nova de Lisboa, UNL, Lisboa, Portugal.
  • Silva H; iMed.ULisboa - Instituto de Investigação do Medicamento, Faculdade de Farmácia, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal.
  • Abilleira F; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Brum C; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Reis AJ; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Macedo M; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Scaini JL; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Silva AB; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Esteves L; Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CDCT), Porto Alegre, Brazil.
  • Macedo R; Departamento de Doenças Infecciosas, Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge, Lisboa, Portugal.
  • Maltez F; Serviço de Doenças Infecciosas, Hospital de Curry Cabral, Lisboa, Portugal.
  • Clemente S; Hospital da Divina Providência, Serviço de Doenças Infecciosas, Luanda, Angola.
  • Coelho E; Programa Nacional de Controlo da Tuberculose, Ministério da Saúde de Moçambique, Mozambique.
  • Viegas S; Instituto Nacional de Saúde, Ministério da Saúde de Moçambique, Mozambique.
  • Rabna P; Instituto Nacional de Saúde Pública, Projecto de Saúde de Bandim (INASA/PSB), Bissau, Guinea-Bissau.
  • Rodrigues A; Instituto Nacional de Saúde Pública, Projecto de Saúde de Bandim (INASA/PSB), Bissau, Guinea-Bissau.
  • Taveira N; iMed.ULisboa - Instituto de Investigação do Medicamento, Faculdade de Farmácia, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal; Centro de Investigação Interdisciplinar Egas Moniz, Instituto Superior de Ciências da Saúde Egas Moniz, Monte de Caparica, Portugal.
  • Jordao L; Departamento de Doenças Infecciosas, Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge, Lisboa, Portugal.
  • Kritski A; Academic Tuberculosis Program, School of Medicine, Federal University of Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
  • Lapa E Silva JR; Thoracic Diseases Institute, Federal University of Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
  • Mokrousov I; Laboratory of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics (former Laboratory of Molecular Microbiology), St. Petersburg Pasteur Institute, St. Petersburg, Russia.
  • Couvin D; WHO Supranational TB Reference Laboratory, Tuberculosis and Mycobacteria Unit, Institut Pasteur de la Guadeloupe, Morne Jolivière Abymes, Guadeloupe, France.
  • Rastogi N; WHO Supranational TB Reference Laboratory, Tuberculosis and Mycobacteria Unit, Institut Pasteur de la Guadeloupe, Morne Jolivière Abymes, Guadeloupe, France.
  • Couto I; Unidade de Microbiologia Médica, Global Health and Tropical Medicine, GHTM, Instituto de Higiene e Medicina Tropical, IHMT, Universidade Nova de Lisboa, UNL, Lisboa, Portugal.
  • Pain A; Pathogen Genomics Laboratory, BESE Division, King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Thuwal, Saudi Arabia.
  • McNerney R; Lung Infection and Immunity Unit, UCT Lung Institute, University of Cape Town, Groote Schuur Hospital, Observatory, 7925, Cape Town, South Africa.
  • Clark TG; London School of Hygiene & Tropical Medicine, Keppel Street, London WC1E 7HT, United Kingdom.
  • von Groll A; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Dalla-Costa ER; Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CDCT), Porto Alegre, Brazil.
  • Rossetti ML; Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CDCT), Porto Alegre, Brazil; Universidade Luterana do Brasil (ULBRA/RS), Porto Alegre, Brazil.
  • Silva PEA; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica, Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Viveiros M; Unidade de Microbiologia Médica, Global Health and Tropical Medicine, GHTM, Instituto de Higiene e Medicina Tropical, IHMT, Universidade Nova de Lisboa, UNL, Lisboa, Portugal.
  • Portugal I; iMed.ULisboa - Instituto de Investigação do Medicamento, Faculdade de Farmácia, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal. Electronic address: isabel.portugal@ff.ulisboa.pt.
Infect Genet Evol ; 72: 44-58, 2019 08.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29559379
Tuberculosis (TB) remains a major health problem within the Community of Portuguese Language Speaking Countries (CPLP). Despite the marked variation in TB incidence across its member-states and continued human migratory flux between countries, a considerable gap in the knowledge on the Mycobacterium tuberculosis population structure and strain circulation between the countries still exists. To address this, we have assembled and analysed the largest CPLP M. tuberculosis molecular and drug susceptibility dataset, comprised by a total of 1447 clinical isolates, including 423 multidrug-resistant isolates, from five CPLP countries. The data herein presented reinforces Latin American and Mediterranean (LAM) strains as the hallmark of M. tuberculosis populational structure in the CPLP coupled with country-specific differential prevalence of minor clades. Moreover, using high-resolution typing by 24-loci MIRU-VNTR, six cross-border genetic clusters were detected, thus supporting recent clonal expansion across the Lusophone space. To make this data available to the scientific community and public health authorities we developed CPLP-TB (available at http://cplp-tb.ff.ulisboa.pt), an online database coupled with web-based tools for exploratory data analysis. As a public health tool, it is expected to contribute to improved knowledge on the M. tuberculosis population structure and strain circulation within the CPLP, thus supporting the risk assessment of strain-specific trends.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Variação Genética / Tuberculose Resistente a Múltiplos Medicamentos / Bases de Dados Genéticas / Mycobacterium tuberculosis Tipo de estudo: Risk_factors_studies Limite: Humans País/Região como assunto: Africa / America do sul / Brasil / Europa Idioma: En Revista: Infect Genet Evol Assunto da revista: BIOLOGIA / DOENCAS TRANSMISSIVEIS / GENETICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de publicação: Holanda
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Variação Genética / Tuberculose Resistente a Múltiplos Medicamentos / Bases de Dados Genéticas / Mycobacterium tuberculosis Tipo de estudo: Risk_factors_studies Limite: Humans País/Região como assunto: Africa / America do sul / Brasil / Europa Idioma: En Revista: Infect Genet Evol Assunto da revista: BIOLOGIA / DOENCAS TRANSMISSIVEIS / GENETICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de publicação: Holanda