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In Silico Analysis of Fatty Acid Desaturase Genes and Proteins in Grasses.
Díaz, Marina Lucía; Cuppari, Selva; Soresi, Daniela; Carrera, Alicia.
Afiliação
  • Díaz ML; Departamento de Biología, Bioquímica y Farmacia, Universidad Nacional del Sur, San Juan 670, 8000, Bahía Blanca, Argentina. mldiaz@criba.edu.ar.
  • Cuppari S; Comisión de Investigaciones Científicas, Buenos Aires, Argentina. mldiaz@criba.edu.ar.
  • Soresi D; Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida (CERZOS)-CONICET, Camino La Carrindanga Km 7, 8000, Bahía Blanca, Argentina.
  • Carrera A; Departamento de Biología, Bioquímica y Farmacia, Universidad Nacional del Sur, San Juan 670, 8000, Bahía Blanca, Argentina.
Appl Biochem Biotechnol ; 184(2): 484-499, 2018 Feb.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28755245
Fatty acid desaturases (FADs) catalyze the introduction of a double bond into acyl chains. Two FAD groups have been identified in plants: acyl-acyl carrier proteins (ACPs) and acyl-lipid or membrane-bound FAD. The former catalyze the conversion of 18:0 to 18:1 and to date have only been identified in plants. The latter are found in eukaryotes and bacteria and are responsible for multiple desaturations. In this study, we identified 82 desaturase gene and protein sequences from 10 grass species deposited in GenBank that were analyzed using bioinformatic approaches. Subcellular localization predictions of desaturase family revealed their localization in plasma membranes, chloroplasts, endoplasmic reticula, and mitochondria. The in silico mapping showed multiple chromosomal locations in most species. Furthermore, the presence of the characteristic histidine domains, the predicted motifs, and the finding of transmembrane regions strongly support the protein functionality. The identification of putative regulatory sites in the promotor and the expression profiles revealed the wide range of pathways in which fatty acid desaturases are involved. This study is an updated survey on desaturases of grasses that provides a comprehensive insight into diversity and evolution. This characterization is a necessary first step before considering these genes as candidates for new biotechnological approaches.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas de Plantas / Simulação por Computador / Regulação Enzimológica da Expressão Gênica / Genes de Plantas / Regulação da Expressão Gênica de Plantas / Ácidos Graxos Dessaturases / Poaceae Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Appl Biochem Biotechnol Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Argentina País de publicação: Estados Unidos
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas de Plantas / Simulação por Computador / Regulação Enzimológica da Expressão Gênica / Genes de Plantas / Regulação da Expressão Gênica de Plantas / Ácidos Graxos Dessaturases / Poaceae Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Appl Biochem Biotechnol Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Argentina País de publicação: Estados Unidos