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Techniques to study epigenetic control and the epigenome in parasites.
Nardelli, Sheila C; Ting, Li-Min; Kim, Kami.
Afiliação
  • Nardelli SC; Instituto Carlos Chagas-Fiocruz, Fiocruz-Paraná. Rua Prof Algacyr Munhoz Mader 3775,CIC, Curitiba - PR, 81.350-010, Brazil.
Methods Mol Biol ; 1201: 177-91, 2015.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25388114
Epigenetics is the study of heritable changes in gene expression that occur independent of the DNA sequence. Due to their intimacy with DNA, histones have a central role in chromatin structure and epigenetic regulation. Their tails are subject to posttranslational modifications (PTMs) that together with chromatin-remodeling proteins control the access of different proteins to DNA and allow a precise response to different environmental conditions. The first part of this chapter is dedicated to histone enrichment methods that allow the study of histones using techniques such as immunoblot or mass spectrometry for the mapping of the histone PTM network. Next we describe chromatin immunoprecipitation-based techniques (ChIP) for study of the epigenome. ChIP followed by microarray or next-generation sequencing enables the precise genomic localization of protein-DNA interactions. These techniques for genome-wide profiling of chromatin provide powerful and efficient tools to study the epigenome.
Assuntos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Parasitos / Histonas / Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos / Epigênese Genética / Epigenômica Limite: Animals Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Parasitos / Histonas / Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos / Epigênese Genética / Epigenômica Limite: Animals Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos