Your browser doesn't support javascript.
loading
TargetCompare: A web interface to compare simultaneous miRNAs targets.
Moreira, Fabiano Cordeiro; Dustan, Bruno; Hamoy, Igor G; Ribeiro-Dos-Santos, André M; Dos Santos, Andrea Ribeiro.
Afiliação
  • Moreira FC; Laboratorio de Genética Humana e Medica, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Para, Belem, PA, Brasil ; Centro Universitário do Pará - Área de Ciências Exatas e Tecnologia, , Belém, PA, Brasil.
  • Dustan B; Laboratorio de Genética Humana e Medica, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Para, Belem, PA, Brasil ; Centro Universitário do Pará - Área de Ciências Exatas e Tecnologia, , Belém, PA, Brasil.
  • Hamoy IG; Laboratorio de Genética Humana e Medica, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Para, Belem, PA, Brasil ; Universidade Federal Rural da Amazônia, Campus de Capanema, PA, Brasil.
  • Ribeiro-Dos-Santos AM; Laboratorio de Genética Humana e Medica, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Para, Belem, PA, Brasil.
  • Dos Santos AR; Laboratorio de Genética Humana e Medica, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Para, Belem, PA, Brasil ; Nucleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Para, Belem, PA, Brasil.
Bioinformation ; 10(9): 602-5, 2014.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25352731
UNLABELLED: MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding nucleotide sequences between 17 and 25 nucleotides in length that primarily function in the regulation of gene expression. A since miRNA has thousand of predict targets in a complex, regulatory cell signaling network. Therefore, it is of interest to study multiple target genes simultaneously. Hence, we describe a web tool (developed using Java programming language and MySQL database server) to analyse multiple targets of pre-selected miRNAs. We cross validated the tool in eight most highly expressed miRNAs in the antrum region of stomach. This helped to identify 43 potential genes that are target of at least six of the referred miRNAs. The developed tool aims to reduce the randomness and increase the chance of selecting strong candidate target genes and miRNAs responsible for playing important roles in the studied tissue. AVAILABILITY: http://lghm.ufpa.br/targetcompare.
Palavras-chave
Texto completo
Adicionar na Minha BVS
Imprimir
XML
PubMed Links
Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Idioma: En Revista: Bioinformation Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Singapura
Texto completo
Adicionar na Minha BVS
Imprimir
XML
PubMed Links
Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Idioma: En Revista: Bioinformation Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Singapura