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HIV type 1 genetic diversity in newly diagnosed Cuban patients.
Machado, Liuber Y; Blanco, Madeline; Dubed, Marta; Díaz, Héctor M; Ruiz, Nancy M; Váldes, Neysi; Romay, Dania; Lobaina, Leonor I.
Afiliação
  • Machado LY; AIDS Research Laboratory, Carretera de Tapaste y Autopista Nacional, San José de las Lajas, Mayabeque, Cuba. liuberyans@infomed.sld.cu
AIDS Res Hum Retroviruses ; 28(8): 956-60, 2012 Aug.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-22059433
Knowledge of the genetic diversity of HIV-1 constitutes a fundamental premise in the epidemiological surveillance. In the present study, the HIV-1 genetic variability from 142 Cuban patients who were diagnosed with HIV-1 infection during 2009 and 2010 was determined. HIV-1 subtypes were determined by partial RT-PCR and sequencing of the HIV-1 pol gene. The phylogenetic analysis showed that 47 (33.1 %) samples were subtypes B and 95 (66.9 %) were non-B subtypes, where G, H, and C subtypes, as well as the recombinant forms CRF19_cpx, CRF18_cpx, and CRFs BG, were included. The circulation of CRF05_DF was detected for the first time in Cuba. The analyses of recombinants showed the presence of recombinant CRF18_cpx/CRF19_cpx. The study confirms the high genetic diversity of HIV-1 and the circulation of new genetic variants in the studied population, which indicates the importance of maintaining constant epidemiological surveillance in Cuba.
Assuntos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Variação Genética / Infecções por HIV / HIV-1 Tipo de estudo: Diagnostic_studies Limite: Adult / Female / Humans / Male País/Região como assunto: Caribe / Cuba Idioma: En Revista: AIDS Res Hum Retroviruses Assunto da revista: SINDROME DA IMUNODEFICIENCIA ADQUIRIDA (AIDS) Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Cuba País de publicação: Estados Unidos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Variação Genética / Infecções por HIV / HIV-1 Tipo de estudo: Diagnostic_studies Limite: Adult / Female / Humans / Male País/Região como assunto: Caribe / Cuba Idioma: En Revista: AIDS Res Hum Retroviruses Assunto da revista: SINDROME DA IMUNODEFICIENCIA ADQUIRIDA (AIDS) Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Cuba País de publicação: Estados Unidos