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Interpretation of electrophoretograms of seven microsatellite loci to determine the genetic diversity of the Arabian Oryx.
Arif, I A; Khan, H A; Shobrak, M; Al Homaidan, A A; Al Sadoon, M; Al Farhan, A H; Bahkali, A H.
Afiliação
  • Arif IA; Molecular Fingerprinting and Biodiversity Unit, Prince Sultan Research Chair for Environment and Wildlife, College of Sciences, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia.
Genet Mol Res ; 9(1): 259-65, 2010 Feb 09.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-20198581
Microsatellite markers are commonly used for examining population structure, especially inbreeding, outbreeding and gene flow. An array of microsatellite loci, preferably with multiallelic presentation, is preferable for ensuring accurate results. However, artifact peaks or stutters in the electrophoretograms significantly hamper the reliable interpretation of genotypes. We interpreted electrophoretograms of seven microsatellite loci to determine the genetic diversity of the Arabian Oryx. All the alleles of different loci exhibited good peak resolutions and hence were clearly identified. Moreover, none of the stutter peaks impaired the recognition or differentiation between homozygote and heterozygote. Our findings suggest that correct identification of alleles in the presence of co-amplified nonspecific fragments is important for reliable interpretation of microsatellite data.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Variação Genética / Antílopes / Repetições de Microssatélites / Loci Gênicos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals País/Região como assunto: Asia Idioma: En Revista: Genet Mol Res Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2010 Tipo de documento: Article País de afiliação: Arábia Saudita País de publicação: Brasil
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