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Small polarons in dry DNA.
Alexandre, Simone S; Artacho, Emilio; Soler, José M; Chacham, H.
Afiliação
  • Alexandre SS; Departamento de Física, ICEx, Universidade Federal de Minas Gerais, C.P. 702, 30123-970 Belo Horizonte, MG, Brazil.
Phys Rev Lett ; 91(10): 108105, 2003 Sep 05.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-14525513
We report ab initio calculations for positively charged fragments of dry poly(dC)-poly(dG) DNA, with up to 4 C-G pairs. We find a strong hole-lattice coupling and clear evidence for the formation of small polarons. The largest geometry distortions occur in only one or two base pairs. They involve the stretching of weak bonds within each base pair, increasing the distance of positive hydrogens, and decreasing that of negative oxygens, to the region in which the hole localizes. We obtain an energy of approximately 0.30 eV for the polaron formation, nearly independent of the chain size. From it, we can estimate an activation energy for polaron hopping of approximately 0.15 eV, consistent with the available experimental value.
Assuntos
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Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Polidesoxirribonucleotídeos / DNA Idioma: En Revista: Phys Rev Lett Ano de publicação: 2003 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos
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Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Polidesoxirribonucleotídeos / DNA Idioma: En Revista: Phys Rev Lett Ano de publicação: 2003 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Estados Unidos