Your browser doesn't support javascript.
loading
Balance de Flujos Metabólicos en Saccharomyces cerevisiae basado en Compartimentalización Intracelular / Metabolic Flows Balance in Saccharomyces cerevisiae based on Intracellular Compartmentalization
Vargas García, César Augusto; García Sánchez, Carlos Eduardo; Arguello Fuentes, Henry; Torres Sáez, Rodrigo Gonzalo.
Afiliação
  • Vargas García, César Augusto; Universidad Industrial de Santander. Bucaramanga. CO
  • García Sánchez, Carlos Eduardo; Universidad Industrial de Santander. Bucaramanga. CO
  • Arguello Fuentes, Henry; Universidad Industrial de Santander. Escuela de Ingeniería de Sistemas e Informática. Bucaramanga. CO
  • Torres Sáez, Rodrigo Gonzalo; Universidad Industrial de Santander. Facultad de Ciencias Básicas. Bucaramanga. CO
Rev. colomb. biotecnol ; 15(2): 18-28, jul.-dic. 2013. graf
Article em Es | LILACS | ID: lil-703333
Biblioteca responsável: CO326
RESUMEN
Una de las técnicas más utilizadas para la predicción de producción de bioproductos y distribución intracelular de flujos de microorganismos es el Análisis de Balance de Flujos - FBA por sus siglas en inglés. El FBA requiere de una función objetivo que represente el objetivo biológico del microorganismo estudiado. En este trabajo se propone un nuevo tipo de funciones objetivo basada en la combinación de objetivos de compartimentos físicos presentes en el microorganismo estudiado. Este tipo de funciones objetivo son examinadas junto con un modelo estequiométrico extraído de la reconstrucción iMM904 del microorganismo S. cerevisiae. Su desempeño se compara con la función objetivo más usada en la literatura, la maximización de biomasa, en condiciones experimentales anaeróbicas en cultivos continuos y aeróbicas en cultivos tipo lote. La función objetivo propuesta en este trabajo mejora las predicciones de crecimiento en un 10% y las predicciones de producción de etanol en un 75% respecto a las obtenidas por la función objetivo de maximización de biomasa, en condiciones anaeróbicas. En condiciones aeróbicas tipo lote la función objetivo propuesta mejora en un 98% las predicciones de crecimiento y en un 70% las predicciones de etanol con respecto a la función objetivo de biomasa.
ABSTRACT
Flux Balance Analysis - FBA - is one of the most used techniques in prediction of microorganism bioproducts. It requires an objective function that represents biological objective of the studied microorganism. This paper presents a new kind of objective functions based on individual physical compartment objetives in the studied microorganism. These kind of functions was tested with a stoichiometric model extracted from iMM904 reconstruction of S. cerevisiae and its performance is compared with the most used objective function in literature, growth maximization, in anaerobic and aerobic batch conditions. The presented objective function outperform growth predictions in 10% and ethanol predictions in 75% compared with obtained by maximization of growth objective function, in anaerobic conditions. In aerobic batch conditions the presented objective function outperforms in 98% growth preditions and 70% ethanol predictions compared with growth maximization.
Assuntos
Palavras-chave
Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: LILACS Assunto principal: Saccharomyces cerevisiae Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: Es Revista: Rev. colomb. biotecnol Assunto da revista: BIOTECNOLOGIA Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article País de afiliação: Colômbia País de publicação: Colômbia
Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: LILACS Assunto principal: Saccharomyces cerevisiae Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: Es Revista: Rev. colomb. biotecnol Assunto da revista: BIOTECNOLOGIA Ano de publicação: 2013 Tipo de documento: Article País de afiliação: Colômbia País de publicação: Colômbia