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Comparative study of RFLP-IS6110 and MIRU-VNTR from Mycobacterium tuberculosis isolated in the state of Minas Gerais, Brazil
Augusto, Cláudio José; Carvalho, Wânia da Silva; Almeida, Isabela Neves de; Figueiredo, Lida Jouca de Assis; Dantas, Nayanne Gama Teixeira; Suffys, Philip Noel; Miranda, Silvana Spíndola de.
Afiliação
  • Augusto, Cláudio José; Fundação Ezequiel Dias. Belo Horizonte. BR
  • Carvalho, Wânia da Silva; Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Belo Horizonte. BR
  • Almeida, Isabela Neves de; Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Belo Horizonte. BR
  • Figueiredo, Lida Jouca de Assis; Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Belo Horizonte. BR
  • Dantas, Nayanne Gama Teixeira; Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Belo Horizonte. BR
  • Suffys, Philip Noel; Fundação Oswaldo Cruz Foundation. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro. BR
  • Miranda, Silvana Spíndola de; Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Belo Horizonte. BR
Braz. j. microbiol ; Braz. j. microbiol;49(3): 641-646, July-Sept. 2018. tab, graf
Article em En | LILACS | ID: biblio-951817
Biblioteca responsável: BR1.1
ABSTRACT
Abstract DNA genotyping of Mycobacterium tuberculosis has been widely applied in the understanding of disease transmission in many countries. The purpose of this study was to genotype the strains of M. tuberculosis isolated in patients with new tuberculosis (TB) cases in Minas Gerais, as well as to compare the similarity, discriminatory power, and agreement of the clusters between the IS6110 Restriction Fragment Length Polymorfism (RFLP) and 12 loci Variable Number Tandem Repeat - Mycobacterial Interspersed Repetitive Units (MIRU-VNTR) techniques. It was observed that 32% (66/204) of the isolated strains in the RFLP-IS6110 and 50.9% (104/204) of the isolated strains in the MIRU-VNTR presented a similarity of equal to or above 85%. The RFLP-IS6110 and MIRU-VNTR proved to contain a high discriminatory power. The similarity index resulting from the RFLP showed no recent transmission. Good agreement was observed between the techniques when clusters were detected; however, the best epidemiological relationship was found when using the RFLP-IS6110.
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: LILACS Assunto principal: Tuberculose / Polimorfismo de Fragmento de Restrição / Técnicas de Tipagem Bacteriana / Repetições Minissatélites / Análise do Polimorfismo de Comprimento de Fragmentos Amplificados / Mycobacterium tuberculosis Limite: Humans País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Braz. j. microbiol Assunto da revista: MICROBIOLOGIA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Brasil
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: LILACS Assunto principal: Tuberculose / Polimorfismo de Fragmento de Restrição / Técnicas de Tipagem Bacteriana / Repetições Minissatélites / Análise do Polimorfismo de Comprimento de Fragmentos Amplificados / Mycobacterium tuberculosis Limite: Humans País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Braz. j. microbiol Assunto da revista: MICROBIOLOGIA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil País de publicação: Brasil