Avaliação do desempenho da PCR em tempo real para o diagnóstico de meningite por Enterovirus / Evaluation of a real-time PCR assay performance for the diagnosis of enteroviral meningitis
Rev. Inst. Adolfo Lutz (Online)
; 75: 1/6-6/6, 2016. tab, graf
Article
em Pt
| SES-SP, LILACS, SESSP-CTDPROD, SES-SP, SESSP-ACVSES, SESSP-IALPROD, SES-SP, SESSP-IALACERVO
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BR91.2
RESUMO
O gênero Enterovirus (EV) é o agente etiológico mais frequente e responsável pela ocorrência de meningite viral no mundo. O objetivo deste trabalho foi de avaliar resultados da implantação do ensaio de PCR em tempo real (RT-qPCR) para a detecção de EV. Foram selecionadas 616amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de pacientes com meningite, recebidas para realizar período de 1998-2013. Os RNAs foram extraídos diretamente do LCR pelo método QIAamp®, e o ensaio TaqMan® foi aplicado. A avaliação foi feita comparando-se resultados de RT-qPCR com os obtidos pelo método de isolamento em cultura de células.Das 616 amostras analisadas, 94 (15,2 %) foram positivas para EV no ensaio de RT-qPCR; e na cultura celular EV foi isolado de 58 (9,4 %) amostras. Valores de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo foram de 89,70 %, 92,40 %, 55,30 % e 98,90 %,respectivamente. O RT-qPCR foi ligeiramente superior à cultura viral para a detecção de EV no LCR. O RT-qPCR TaqMan® é um ensaio rápido e sensível, facilmente exeqüível e com potencial para melhorar o diagnóstico da meningite viral na rotina do laboratório de saúde pública noEstado de São Paulo.
ABSTRACT
The genus Enterovirus (EV) is the most frequent etiological agent responsible for the occurrence of viral meningitis in the world. The objective of this work was to evaluate the results of the implantation of the real-time PCR assay (RT-qPCR) for the detection of EV. We selected 616 samples of cerebrospinal fluid (CSF) from patients with meningitis, received for the period 1998-2013. The RNAs were extracted directly from the CSF by the QIAamp® method, and the TaqMan® assay was applied. The results of the RT-qPCR test were compared with those obtained by the cell culture isolation method. Of the 616 samples analyzed, 94 (15.2%) were positive for EV in the RT-qPCR assay; And cell culture EV was isolated from 58 (9.4%) samples. Sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive values were 89.70%, 92.40%, 55.30% and 98.90%, respectively. The RT-qPCR was slightly superior to the viral culture for the detection of EV in the CSF. RT-qPCR TaqMan® is a rapid and sensitive, easily feasible and potential test to improve the diagnosis of viral meningitis in the routine of the public health laboratory in the State of São Paulo.
Palavras-chave
Texto completo:
1
Coleções:
01-internacional
Base de dados:
LILACS
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SES-SP
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SESSP-IALPROD
Assunto principal:
Reação em Cadeia da Polimerase
/
Enterovirus
/
Meningite
Tipo de estudo:
Diagnostic_studies
/
Prognostic_studies
Idioma:
Pt
Revista:
Rev. Inst. Adolfo Lutz (Online)
Assunto da revista:
Medicina
/
Microbiologia
/
Sa£de P£blica
Ano de publicação:
2016
Tipo de documento:
Article
País de publicação:
Brasil