Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru
Acta med. peru
; 39(4)oct. 2022.
Article
em En
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LILACS-Express
| LILACS
| ID: biblio-1419911
Biblioteca responsável:
PE1.1
ABSTRACT
Objective:
To compare the isothermal molecular screening techniques CPA and RT-LAMP, against the gold standard test, reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), and to determine its agreement. Materials andMethods:
Paired comparative case-control study. For the evaluation of the CPA method, 70 cases and 130 controls were used, while for RT-LAMP, 30 cases and 70 controls were used. The sensitivity and specificity of both tests were calculated. Subsequently, the bias-corrected Kappa index was calculated by resampling.Results:
Both techniques have adequate and equivalent values of sensitivity (RT-LAMP 82.8%, CPA 83%) and specificity (RT-LAMP and CPA 91.5%), as well as a high concordance (88%), and Kappa-index (0.72).Conclusion:
Both isothermal molecular screening techniques are suitable for SARS-CoV-2 screening, with a similar sensitivity and specificity.RESUMEN
Objetivo:
Comparar las técnicas de cribado molecular isotérmico CPA y RT-LAMP, frente a la prueba de referencia, la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR), y determinar su concordancia. Materiales ymétodos:
Estudio comparativo de casos y controles emparejados. Para la evaluación del método CPA se utilizaron 70 casos y 130 controles, mientras que para la RT-LAMP se utilizaron 30 casos y 70 controles. Se calcularon la sensibilidad y la especificidad de ambas pruebas. Posteriormente, se calculó el índice Kappa corregido por sesgo mediante un nuevo muestreo.Resultados:
Ambas técnicas presentan valores adecuados y equivalentes de sensibilidad (RT-LAMP 82,8 %, CPA 83 %) y especificidad (RT-LAMP y CPA 91,5 %), así como una alta concordancia (88 %), y un índice Kappa (0,72).Conclusiones:
Ambas técnicas de cribado molecular isotérmico son adecuadas para el cribado del SARS-CoV-2, con una sensibilidad y especificidad similares.
Texto completo:
1
Coleções:
01-internacional
Base de dados:
LILACS
Tipo de estudo:
Diagnostic_studies
/
Observational_studies
/
Screening_studies
País/Região como assunto:
America do sul
/
Peru
Idioma:
En
Revista:
Acta med. peru
Assunto da revista:
MEDICINA
Ano de publicação:
2022
Tipo de documento:
Article
País de publicação:
Peru