Caracterização molecular dos diferentes componentes de tumor de Wilms / Molecular characterization of the different components of Wilms tumor
São Paulo; s.n; 2005. 115 p. ilus, tab.
Thesis
em Pt
| Inca
| ID: biblio-1118285
Biblioteca responsável:
BR30.1
Localização: BR30.1
RESUMO
O tumor de Wilms (TW) é uma neoplasia morfologicamente complexa com 3 componentes histologicamente distintos encontrados em diferentes proporções blastematoso, epitelial e estromal. A tumorigênese dos TW é de grande complexidade. Cada componente representa um estágio de desenvolvimento diferente do rim embrionário e possui características próprias de agressividade e resposta a tratamento. Os arranjos observados envolvendo os três componentes parecem recapitular estágios diferentes da embriogênese renal e estão presentes em proporções variáveis com diversidade de arranjo arquitetura! e graus de diferenciação. Alguns eventos histológicos e biológicos têm sido sugeridos como capazes de desencadear ou manter a tumorigênese, entretanto as etapas desse mecanismo ainda são desconhecidas. WT1 é um gene que foi envolvido na tumorigênese de alguns casos de TWs e é importante para o desenvolvimento do trato genitourinário.Para melhor compreensão da biologia do TW, analisamos a expressão gênica de cada componente separadamente através de cDNA microarray. A casuística inclui 4 amostras de componente blastematoso, 5 amostras de componente epitelial e 3 amostras de componente estromal. As amostras foram congeladas logo após a cirurgia e microdissecadas por bisturi ou laser. O RNA total extraído foi submetido à amplificação, marcado e hibridizado em lâmina contendo 4608 seqüências de ORESTES originadas do Projeto Genoma do Câncer, representando diferentes genes humanos. Todas as amostras foram marcadas em duplicata, invertendo o fluoróforo, e co-hibridizadas com um RNA referência. Após a hibridização, os dados foram capturados e normalizados. Foram considerados genes diferencialmente expressos aqueles que tiveram pelo menos duas vezes de diferença de expressão e p menor que 0,01, comparando-se os componentes 2 a 2. A comparação entre os 3 componentes mostrou que eles têm perfis de expressão gênica diferentes, sendo que ao se observar o número de genes diferencialmente expressos entre eles, o componente blastematoso mostrou-se mais distinto do componente estromal do que do componente epitelial, e essa diferença é menor entre os componentes estromal e epitelial. Esses genes são capazes de discriminar o componente blastematoso do estromal, e o componente epitelial é discriminado na provável dependência do tratamento da amostra. Analisando as vias de sinalização celular, 54 genes da via WNT estão representados na lâmina e 12 deles estão diferencialmente expressos entre os componentes e são capazes de discriminar os diferentes componentes dos TWs. As 4 isoformas de WT1 foi analisado mostrando que não há nenhum padrão característico de cada componente, sendo que as diferenças apresentadas nos padrões são dependentes do indivíduo e não do componente do tumor.
ABSTRACT
Wilms tumors (WT) are morphologically complex neoplasm with 3 distinct histological components blastemal, epithelial and stromal, which are found in different proportions. Each component represents a different stage of the kidney embryonic development and it has its own characteristic of aggressiveness and response to chemotherapy. WT have been considered a prototype for arrested cellular differentiation in human cancer. Previous assessments of the WT have relied on histology and few selected markers. WT1 is a gene important to genito-urinary tract and it has been involved in some WT cases. To better understand the WT biology, we analysed the gene expression pattern of each component individually using the microarray (MA) experiment. Components were selected from 12 frozen tumors (4 blastemal components, 5 epithelial components and 3 stromal components.) They were scalpel or laser capture microdissected and total RNA was extracted and amplified in two rounds using T? based technology. eMA was performed on a customized cDNA platform containing 4,608 ORESTES representing different human genes. lt was used reference design with dye swap as dupricate. Fluorescent intensities of Cy5 and Cy3 channels on each sl\de were subjected to spot filtering and normalization. Permuted Student test was used for statistical analysis in arder to determine the p-value for the expression of each individual gene in the different analyzed class. lt was considered as differentially expressed genes those which expression levei was at least 2 fold and p value lower than 0.01 between groups. Comparing the 3 components, each of them has an specific molecular profiling, and considering only the differentially expressed genes, blastemal component showed to be more different of the stromal component than of epithelial component, and this difference is smaller between blastemal and epithelial components. Deregulated genes of the comparisons were able to discriminate the blastemal component from the stromal component and the epithelial component showed to be similar to both others depending on treatment of the samples. Fifty-four WNT signaling pathway genes presented in the platform were analyzed among the different components and 12 of them showed to be differently regulated, being capable of discriminate the components Analyses of 4 variants of WT1 was dane in each component showing that the variants profiling is dependent on the tumors and not of the components tumor.
Palavras-chave
Texto completo:
1
Base de dados:
Inca
Assunto principal:
Genes do Tumor de Wilms
/
Tumor de Wilms
/
Rim
Limite:
Adolescent
/
Child
/
Child, preschool
/
Female
/
Humans
/
Infant
/
Male
/
Newborn
Idioma:
Pt
Ano de publicação:
2005
Tipo de documento:
Thesis
País de publicação:
Brasil