Identificação de marcadores moleculares para o câncer de mama por meio da análise da expressão gênica I / ldentification of breast tumor molecular markers by gene expression analysis
São Paulo; s.n; 2004. 111 p. tab, ilus.
Thesis
em Pt
| Inca
| ID: biblio-1117825
Biblioteca responsável:
BR30.1
Localização: BR30.1
RESUMO
O câncer de mama é a neoplasia mais freqüente que acomete as mulheres do mundo todo. Embora exista um considerável progresso no diagnóstico precoce e no tratamento desse tipo de tumor, a mortalidade por essa doença ainda permanece relativamente alta. Tumores de mama com aparentemente o mesmo tipo histológico e estadiamento variam amplamente em sua resposta às terapias disponíveis. A identificação de genes diferencialmente expressos no câncer de mama em relação ao tecido ao normal é de extrema importância para o entendimento da biologia do processo de tumorigênese e na identificação de novos potenciais marcadores de diagnóstico, prognóstico e no desenvolvimento de alvos terapêuticos. Neste trabalho, a análise do perfil da expressão gênica por meio de utilização dos dados disponibilizados pelo banco de SAGE resultou na identificação de 175 genes, os quais apresentaram um aumento da expressão de pelo menos quatro vezes em relação ao tecido normal. Levando-se em consideração a função celular, o processo biológico em que o gene está envolvido, a disponibilidade de anticorpos comerciais, e a localização celular, 19 genes (ALPPL2, BIRC5, CAD, CELSR2, CTSF, DGCR6, EFNA4, EI24, FN3KR3, GATA3, GATA4, HMG20B, PTPRF, QSCN6, SCARB2, STARD10, ZC3HDC1, KIAA0141 e KIF22) foram selecionados para terem sua expressão diferencial avaliada por meio de RT-PCR em tempo real em vinte e duas amostras de tecidos tumorais de mama, em estágio inicial de desenvolvimento da doença (menores do que dois centímetros) e em uma mistura de amostras não tumorais. A quantificação da expressão desses genes revelou que dez deles (ALPPL2, CELSR2, FN3KR3, GATA3, GATA4, HMG20B, QSCN6, SCARB2, STARD10 e ZC3HDC1) apresentaram-se com aumento da expressão de pelo menos duas vezes em mais de 25% das amostras testadas, em relação à mistura de tecidos normais. Os genes ALPPL2, CELSR2, GATA 3 e HMG20B, apresentaram aumento de expressão em mais de 50% das amostras analisadas. A correlação entre o aumento de expressão dos genes CELSR2, GATA3, GATA4 e KIAA0141 e a positividade para a imunodetecção de receptor de estrógeno se mostrou estatisticamente significativa (com valores de p iguais a 0,0270; 0,0223 e 0,0146 e 0,0325, respectivamente). A associação entre a expressão do gene CELSR2 e a positividade para a imunodetecção do receptor de progesterona se mostrou estatisticamente significativa (p=0,0278). Os resultados apresentados no presente estudo demonstraram que a estratégia de escolha de genes a partir da análise de banco de dados públicos disponíves on line foi adequada, por terem sido validados como apresentando aumento de expressão por meio de RT-PCR em tempo real mais da metade dos genes selecionados nas amostras analisadas. Embora os resultados obtidos forneçam indícios de uma provável correlação entre o aumento da expressão dos genes e o processo de tumorigênese de mama, um estudo mais amplo, com um maior número de amostras será necessário para a confirmação dos achados.
ABSTRACT
Breast cancer is one o f the most common malignancies and the main cause of death among women. Although there have been a considerable progress on early diagnosis and treatment, the rates of mortality due to breast cancer among women remain still high. Breast cancer is characterized by an important histoclinical heterogeneity, which makes difficult the selection of the most appropriate treatment for each case. The identification of genes differentially expressed in breast cancer has important implications in understanding the biology of breast tumorigenesis and in the identification of new potential diagnostic and prognostic markers and in the development of therapeutic targets. Expression profiling using the public serial analysis of gene expression (SAGE) database resulted in the identification of 175 genes, which were at least 4 fold overexpressed in breast cancer SAGE libraries when compared to the normal breast SAGE libraries. Considering the cell function, biological processes in which the genes are involved, cell localization and the commercial availability of antibodies, 19 candidate genes (ALPPL2, BIRC5, CAD, CELSR2, CTSF, DGCR6, EFNA4, E/24, FN3KR3, GATA3, GATA4, HMG20B, PTPRF, QSCN6, SCARB2, STARDJO, ZC3HDCI, KJAA0141 e KIF22) were selected to have the differential expression tested by Real Time RT-PCR in 22 breast cancer samples smaller than two centimeters compared to a pool of normal breast tissues. Eleven of these genes (ALPPL2 , CELSR2, FN3KR3, GATA3 , GATA4, HMG20B, PTPRF, QSCN6, SCARB2, STARDIO and ZC3HDCJ) showed a significant overexpression o f at least 2 fold in more than 25% o f the breast tumor samples tested. The genes ALPPL2, CELSR2, GATA 3 e HMG20B were found overexpressed in more than 50o/o of the samples analyzed. The statistical analysis showed a significant correlation between the overexpression of the genes CELSR2 , GATA3, GATA4 and KIAAOI41 and the estrogen receptor immunodetection (the p values were 0.0270; 0.0223 , 0.0146, and 0.0325 , respectively). The association between the overexpression of CELSR2 and the progesterone receptor immunodetection was also statistically significant (p=0.0278). These preliminary results suggest that data mining of SAGE database seems to be an appropriate approach to identify differentially expressed genes in breast tumors. The results also suggest that these genes may be implicated in breast tumorigenesis, but further studies with larger series are needed to confirm our findings.
Palavras-chave
Texto completo:
1
Base de dados:
Inca
Assunto principal:
Neoplasias da Mama
/
Biomarcadores
/
Expressão Gênica
Idioma:
Pt
Ano de publicação:
2004
Tipo de documento:
Thesis
País de publicação:
Brasil