Conjugation of NMR and SAXS for multidomain protein structure determination: from sample preparation to model refinement / Conjugación de NMR y SAXS para la determinación estructural de proteínas multidominio: de la preparación de muestras al refinamiento de modelo
Nucleus (La Habana)
; (64): 49-53, July.-Dec. 2018. graf
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| ID: biblio-1002728
Biblioteca responsável:
CU1.1
ABSTRACT
Abstract Experimental information from small angle X-ray scattering (SAXS) is conjugated with nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy data for the improvement of protein structure determination, particularly for flexible, multidomain or intrinsically disordered proteins. Individually, each of these techniques presents capabilities and limitations:
NMR excels in local information, providing atomic resolution, but is limited by protein size, whereas SAXS yields a global envelope of the protein with lower resolution, but revealing domain positions. Different conjugation methodologies use the complementarity of both technique´s independent constraints to accomplish a comprehensive protein structure determination and dynamics understanding at a moderate computational expense.RESUMEN
Resumen Se conjuga información experimental proveniente de dispersión de rayos X a ángulos pequeños (SAXS) con la espectroscopía de resonancia magnética nuclear (NMR) para perfeccionar la determinación de la estructura protéica, en particular de proteínas flexibles, de multidominio o intrínsecamente desordenadas. Individualmente, cada una de estas técnicas presenta capacidades y limitaciones NMR se destaca en la información local, proporcionando resolución atómica, pero está limitada por el tamaño de la proteína, mientras que SAXS produce una envoltura global de la proteína con una resolución menor pero revelando las posiciones de los dominios. Las diferentes metodologías de conjugación utilizan la complementariedad de las restricciones independientes de ambas técnicas para seguir estrategias adecuadas de acuerdo con la proteína, logrando una determinación integral de la estructura y una comprensión de las dinámicas del sistema proteico a un costo computacional moderado.
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1
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01-internacional
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LILACS
Idioma:
En
Revista:
Nucleus (La Habana)
Assunto da revista:
MEDICINA NUCLEAR
/
RADIOTERAPIA
Ano de publicação:
2018
Tipo de documento:
Article
País de afiliação:
México
País de publicação:
Cuba