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Probing Affinity, Avidity, Anti-Cooperativity, and Competition in Antibody and Receptor Binding to the SARS-CoV-2 Spike by Single Particle Mass Analyses
Preprint
en En
| PREPRINT-BIORXIV
| ID: ppbiorxiv-448939
Artículo de revista
Un artículo publicado en revista científica está disponible y probablemente es basado en este preprint, por medio del reconocimiento de similitud realizado por una máquina. La confirmación humana aún está pendiente.
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ABSTRACT
Determining how antibodies interact with the spike (S) protein of the SARS-CoV-2 virus is critical for combating COVID-19. Structural studies typically employ simplified, truncated constructs that may not fully recapitulate the behaviour of the original complexes. Here, we combine two single particle mass analysis techniques (mass photometry and charge-detection mass spectrometry) to enable measurement of full IgG binding to the trimeric SARS-CoV-2 S ectodomain. Our experiments reveal that antibodies targeting the S-trimer typically prefer stoichiometries lower than the symmetry-predicted 31 binding. We determine that this behaviour arises from the interplay of steric clashes and avidity effects that are not reflected in common antibody constructs (i.e. Fabs). Surprisingly, these sub-stoichiometric complexes are fully effective at blocking ACE2 binding despite containing free receptor binding sites. Our results highlight the importance of studying antibody/antigen interactions using complete, multimeric constructs and showcase the utility of single particle mass analyses in unraveling these complex interactions.
cc_by_nc_nd
Texto completo:
1
Colección:
09-preprints
Base de datos:
PREPRINT-BIORXIV
Tipo de estudio:
Prognostic_studies
Idioma:
En
Año:
2021
Tipo del documento:
Preprint