Detection of SARS-CoV-2 RNA by multiplex RT-qPCR

Eriko Kudo; Benjamin Israelow; Chantal Vogels; Peiwen Lu; Anne L Wyllie; Maria Tokuyama; Arvind Venkataraman; Doug E Brackney; Isabel Ott; Mary Petrone; Rebecca Earnest; Sarah Lapidus; Catherine Muenker; Adam Moore; Arnau Casanovas-Massana; - Yale IMPACT Research Team; Saad Omer; Charles Dela Cruz; Shelli Farhadian; Albert Ko; Nathan Grubaugh; Akiko Iwasaki

Este articulo es un Preprint

Los preprints son informes de investigación preliminares que no han sido certificados por revisión por pares. No deben considerarse para guiar la práctica clínica o los comportamientos relacionados con la salud y no deben publicarse en los medios como información establecida.

Los preprints publicados en línea permiten a los autores recibir comentarios rápidamente, y toda la comunidad científica puede evaluar de forma independiente el trabajo y responder adecuadamente. Estos comentarios se publican junto con los preprints para que cualquiera pueda leer y servir como una revisión pospublicación.

Detection of SARS-CoV-2 RNA by multiplex RT-qPCR

Eriko Kudo; Benjamin Israelow; Chantal Vogels; Peiwen Lu; Anne L Wyllie; Maria Tokuyama; Arvind Venkataraman; Doug E Brackney; Isabel Ott; Mary Petrone; Rebecca Earnest; Sarah Lapidus; Catherine Muenker; Adam Moore; Arnau Casanovas-Massana; - Yale IMPACT Research Team; Saad Omer; Charles Dela Cruz; Shelli Farhadian; Albert Ko; Nathan Grubaugh; Akiko Iwasaki.

Afiliación

Eriko Kudo; Yale University
Benjamin Israelow; Yale University
Chantal Vogels; Yale University
Peiwen Lu; Yale University
Anne L Wyllie; Yale School of Public Health
Maria Tokuyama; University of California, Berkeley
Arvind Venkataraman; Yale University
Doug E Brackney; The Connecticut Agricultural Experiment Station
Isabel Ott; Yale University
Mary Petrone; Yale University
Rebecca Earnest; Yale University
Sarah Lapidus; Yale University
Catherine Muenker; Yale University
Adam Moore; Yale Univeristy
Arnau Casanovas-Massana; Yale University
- Yale IMPACT Research Team;
Saad Omer; saad.omer@yale.edu
Charles Dela Cruz; Yale University
Shelli Farhadian; Yale School of Medicine
Albert Ko; Yale University School of Public Health
Nathan Grubaugh; Yale University
Akiko Iwasaki; Yale University School of Medicine

Preprint en En | PREPRINT-BIORXIV | ID: ppbiorxiv-155887

Artículo de revista
Un artículo publicado en revista científica está disponible y probablemente es basado en este preprint, por medio del reconocimiento de similitud realizado por una máquina. La confirmación humana aún está pendiente.
Ver artículo de revista

ABSTRACT

ABSTRACT

The current RT-qPCR assay recommended for SARS-CoV-2 testing in the United States requires analysis of three genomic targets per sample two viral and one host. To simplify testing and reduce the volume of required reagents, we developed a multiplex RT-qPCR assay to detect SARS-CoV-2 in a single reaction. We used existing N1, N2, and RP primer and probe sets by the CDC, but substituted fluorophores to allow multiplexing of the assay. The cycle threshold (Ct) values of our multiplex RT-qPCR were comparable to those obtained by the singleplex assay adapted for research purposes. Low copies (>500 copies / reaction) of SARS-CoV-2 RNA were consistently detected by the multiplex RT-qPCR. Our novel multiplex RT-qPCR improves upon current singleplex diagnostics by saving reagents, costs, time and labor.

Licencia

cc_by_nc_nd

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 09-preprints Base de datos: PREPRINT-BIORXIV Idioma: En Año: 2020 Tipo del documento: Preprint

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 09-preprints Base de datos: PREPRINT-BIORXIV Idioma: En Año: 2020 Tipo del documento: Preprint