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Evaluating the efficacy of RT-qPCR SARS-CoV-2 direct approaches in comparison to RNA extraction
Ofir Israeli; Adi Beth-Din; Nir Paran; Dana Stein; Shirley Lazar; Shay Weiss; Elad Milrot; Yafit Atiya-Nasagi; Shmuel Yitzhaki; Orly Laskar; Ofir Schuster.
Afiliación
  • Ofir Israeli; IIBR
  • Adi Beth-Din; IIBR
  • Nir Paran; IIBR
  • Dana Stein; IIBR
  • Shirley Lazar; IIBR
  • Shay Weiss; IIBR
  • Elad Milrot; IIBR
  • Yafit Atiya-Nasagi; IIBR
  • Shmuel Yitzhaki; IIBR
  • Orly Laskar; IIBR
  • Ofir Schuster; IIBR
Preprint en En | PREPRINT-BIORXIV | ID: ppbiorxiv-144196
Artículo de revista
Un artículo publicado en revista científica está disponible y probablemente es basado en este preprint, por medio del reconocimiento de similitud realizado por una máquina. La confirmación humana aún está pendiente.
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ABSTRACT
SARS-CoV-2 genetic identification is based on viral RNA extraction prior to RT-qPCR assay, however recent studies support the elimination of the extraction step. Herein, we assessed the RNA extraction necessity, by comparing RT-qPCR efficacy in several direct approaches vs. the gold standard RNA extraction, in detection of SARS-CoV-2 from laboratory samples as well as clinical Oro-nasopharyngeal SARS-CoV-2 swabs. Our findings show advantage for the extraction procedure, however a direct no-buffer approach might be an alternative, since it identified up to 70% of positive clinical specimens.
Licencia
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Texto completo: 1 Colección: 09-preprints Base de datos: PREPRINT-BIORXIV Tipo de estudio: Experimental_studies / Prognostic_studies Idioma: En Año: 2020 Tipo del documento: Preprint
Texto completo: 1 Colección: 09-preprints Base de datos: PREPRINT-BIORXIV Tipo de estudio: Experimental_studies / Prognostic_studies Idioma: En Año: 2020 Tipo del documento: Preprint