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Satellitome Analysis in the Southern Lapwing (Vanellus chilensis) Genome: Implications for SatDNA Evolution in Charadriiform Birds.
Kretschmer, Rafael; Toma, Gustavo A; Deon, Geize Aparecida; Dos Santos, Natalia; Dos Santos, Rodrigo Zeni; Utsunomia, Ricardo; Porto-Foresti, Fabio; Gunski, Ricardo José; Garnero, Analía Del Valle; Liehr, Thomas; de Oliveira, Edivaldo Herculano Corra; de Freitas, Thales Renato Ochotorena; Cioffi, Marcelo de Bello.
Afiliación
  • Kretschmer R; Departamento de Ecologia, Zoologia e Genética, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas 96010-900, RS, Brazil.
  • Toma GA; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos 13565-905, SP, Brazil.
  • Deon GA; Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos 13565-905, SP, Brazil.
  • Dos Santos N; Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru 13506-900, SP, Brazil.
  • Dos Santos RZ; Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru 13506-900, SP, Brazil.
  • Utsunomia R; Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru 13506-900, SP, Brazil.
  • Porto-Foresti F; Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru 13506-900, SP, Brazil.
  • Gunski RJ; Laboratório de Diversidade Genética Animal, Universidade Federal do Pampa, São Gabriel 97300-162, RS, Brazil.
  • Garnero ADV; Laboratório de Diversidade Genética Animal, Universidade Federal do Pampa, São Gabriel 97300-162, RS, Brazil.
  • Liehr T; Institute of Human Genetics, Friedrich Schiller University, University Hospital Jena, 07747 Jena, Germany.
  • de Oliveira EHC; Laboratório de Citogenô mica e Mutagênese Ambiental, Seção de Meio Ambiente, Instituto Evandro Chagas, Ananindeua 67030-000, PA, Brazil.
  • de Freitas TRO; Instituto de Ciências Exatas e Naturais, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, PA, Brazil.
  • Cioffi MB; Laboratório de Citogenética e Evolução, Departamento de Genética, Instituto de Biociências, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre 91509-900, RS, Brazil.
Genes (Basel) ; 15(2)2024 02 19.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-38397247
ABSTRACT
Vanellus (Charadriidae; Charadriiformes) comprises around 20 species commonly referred to as lapwings. In this study, by integrating cytogenetic and genomic approaches, we assessed the satellite DNA (satDNA) composition of one typical species, Vanellus chilensis, with a highly conserved karyotype. We additionally underlined its role in the evolution, structure, and differentiation process of the present ZW sex chromosome system. Seven distinct satellite DNA families were identified within its genome, accumulating on the centromeres, microchromosomes, and the W chromosome. However, these identified satellite DNA families were not found in two other Charadriiformes members, namely Jacana jacana and Calidris canutus. The hybridization of microsatellite sequences revealed the presence of a few repetitive sequences in V. chilensis, with only two out of sixteen displaying positive hybridization signals. Overall, our results contribute to understanding the genomic organization and satDNA evolution in Charadriiform birds.
Asunto(s)
Palabras clave

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Charadriiformes Límite: Animals País/Región como asunto: America do sul / Chile Idioma: En Revista: Genes (Basel) Año: 2024 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Suiza

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Charadriiformes Límite: Animals País/Región como asunto: America do sul / Chile Idioma: En Revista: Genes (Basel) Año: 2024 Tipo del documento: Article País de afiliación: Brasil Pais de publicación: Suiza