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Genomic Characterization of Two NDM-5-Producing Isolates of Klebsiella pneumoniae ST11 from a Single Patient.
Álvarez, Verónica E; Carrera Páez, Laura; Piekar, María; García Allende, Natalia; Campos, Josefina; Mendiondo, Nicolás; Aguilar, Andrea; Fox, Barbara; Fernández-Canigia, Liliana; Quiroga, María P; Centrón, Daniela.
Afiliación
  • Álvarez VE; Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPaM, UBA-CONICET), Laboratorio de Investigaciones en Mecanismos de Resistencia a Antibióticos (LIMRA), Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.
  • Carrera Páez L; Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPaM, UBA-CONICET), Laboratorio de Investigaciones en Mecanismos de Resistencia a Antibióticos (LIMRA), Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.
  • Piekar M; Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPaM, UBA-CONICET), Nodo Bioinformático, Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.
  • García Allende N; Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPaM, UBA-CONICET), Laboratorio de Investigaciones en Mecanismos de Resistencia a Antibióticos (LIMRA), Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.
  • Campos J; Hospital Alemán, Buenos Aires, Argentina.
  • Mendiondo N; Plataforma de Genómica y Bioinformática, INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán", Buenos Aires, Argentina.
  • Aguilar A; Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPaM, UBA-CONICET), Nodo Bioinformático, Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.
  • Fox B; Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPaM, UBA-CONICET), Nodo Bioinformático, Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.
  • Fernández-Canigia L; Hospital Alemán, Buenos Aires, Argentina.
  • Quiroga MP; Hospital Alemán, Buenos Aires, Argentina.
  • Centrón D; Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica (IMPaM, UBA-CONICET), Laboratorio de Investigaciones en Mecanismos de Resistencia a Antibióticos (LIMRA), Facultad de Medicina, Universidad de Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina.
Curr Microbiol ; 81(3): 76, 2024 Jan 25.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-38267719
ABSTRACT
Two metallo-ß-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae (HA30 and HA31) were isolated in a hospital in Argentina during 2018. K. pneumoniae HA30 was isolated from a rectal swab during the epidemiological surveillance for carbapenemase-producing strains, while K. pneumoniae HA31 was collected from the same patient 4 days after hospitalization. The aim of the present study was to identify the clonal relationships and resistome of these two NDM-producing K. pneumoniae strains isolated from a patient with a fatal outcome. Whole-genome sequencing (WGS) was performed using Illumina MiSeq-I, and subsequent analysis involved genome assembly, annotation, antibiotic resistance gene identification, multilocus sequence typing (MLST), and plasmid characterization using bioinformatics tools. Conjugation assays to E. coli J53 was conducted as previously described. K. pneumoniae HA30 exhibited extensively drug-resistant phenotype, while HA31 was multidrug-resistant as defined by Magiorakos et al., including both resistance to carbapenems, aminoglycosides and ciprofloxacin with blaNDM-5, blaCTX-M-15 and rmtB genes found in both strains. MLST analysis showed that both strains belonged to ST11, differing by only 4 cgSNPs, indicating that K. pneumoniae HA30 and HA31 were the same strain. Conjugation assays revealed that K. pneumoniae HA31 strain possessed a transferable plasmid to E. coli J53. Bioinformatics studies identified that the same strain colonizing an inpatient during hospital admission subsequently caused the infection leading to a fatal outcome, being the first report of blaNDM-5, rmtB and blaCTX-M-15 genes in a K. pneumoniae ST11 strain from Latin America. Our results also highlighted the importance of focusing on epidemiological surveillance programs.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Escherichia coli / Klebsiella pneumoniae Límite: Humans Idioma: En Revista: Curr Microbiol Año: 2024 Tipo del documento: Article País de afiliación: Argentina Pais de publicación: Estados Unidos
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