Pan-genome de Bruijn graph using the bidirectional FM-index.

Depuydt, Lore; Renders, Luca; Abeel, Thomas; Fostier, Jan

Depuydt, Lore; Renders, Luca; Abeel, Thomas; Fostier, Jan.

Afiliación

Depuydt L; Department of Information Technology - IDLab, Ghent University - imec, Technologiepark 126, 9052, Ghent, Belgium. Lore.Depuydt@UGent.be.
Renders L; Department of Information Technology - IDLab, Ghent University - imec, Technologiepark 126, 9052, Ghent, Belgium.
Abeel T; Delft Bioinformatics Lab, Delft University of Technology, 2628 XE, Delft, The Netherlands.
Fostier J; Infectious Disease and Microbiome Program, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, 02142, USA.

BMC Bioinformatics ; 24(1): 400, 2023 Oct 26.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37884897

Asunto(s)

Algoritmos; Genoma; Análisis de Secuencia de ADN; Programas Informáticos; Biología Computacional

Palabras clave

Approximate pattern matching; Lossless alignment; Pan-genome visualization; Search schemes; Sequence-to-graph alignment

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos / Genoma Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Bélgica Pais de publicación: Reino Unido

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google