Identification of Plant Transcription Factor DNA-Binding Sites Using seq-DAP-seq.

Hutin, Stephanie; Blanc-Mathieu, Romain; Rieu, Philippe; Parcy, François; Lai, Xuelei; Zubieta, Chloe

Hutin, Stephanie; Blanc-Mathieu, Romain; Rieu, Philippe; Parcy, François; Lai, Xuelei; Zubieta, Chloe.

Afiliación

Hutin S; Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, CNRS, CEA, Université Grenoble Alpes, INRAE, IRIG, CEA Grenoble, Grenoble, France.
Blanc-Mathieu R; Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, CNRS, CEA, Université Grenoble Alpes, INRAE, IRIG, CEA Grenoble, Grenoble, France.
Rieu P; Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, CNRS, CEA, Université Grenoble Alpes, INRAE, IRIG, CEA Grenoble, Grenoble, France.
Parcy F; Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, CNRS, CEA, Université Grenoble Alpes, INRAE, IRIG, CEA Grenoble, Grenoble, France.
Lai X; Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, CNRS, CEA, Université Grenoble Alpes, INRAE, IRIG, CEA Grenoble, Grenoble, France.
Zubieta C; National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Hubei Hongshan Laboratory, Huazhong Agricultural University, Wuhan, China.

Methods Mol Biol ; 2698: 119-145, 2023.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37682473

Asunto(s)

Regulación de la Expresión Génica; Factores de Transcripción; ADN de Plantas/genética; Factores de Transcripción/genética; Sitios de Unión; Análisis de Secuencia de ADN

Palabras clave

DNA affinity purification sequencing (DAP-seq); DNA methylation; Recombinant protein expression; Sequential DNA affinity purification sequencing (seq-DAP-seq); Sequential pull-down; Transcription factor binding sites (TFBS); Transcription factors (TF)

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Factores de Transcripción / Regulación de la Expresión Génica Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia Pais de publicación: Estados Unidos

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