Unsupervised removal of systematic background noise from droplet-based single-cell experiments using CellBender.

Fleming, Stephen J; Chaffin, Mark D; Arduini, Alessandro; Akkad, Amer-Denis; Banks, Eric; Marioni, John C; Philippakis, Anthony A; Ellinor, Patrick T; Babadi, Mehrtash

Fleming, Stephen J; Chaffin, Mark D; Arduini, Alessandro; Akkad, Amer-Denis; Banks, Eric; Marioni, John C; Philippakis, Anthony A; Ellinor, Patrick T; Babadi, Mehrtash.

Afiliación

Fleming SJ; Data Sciences Platform, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA. sfleming@broadinstitute.org.
Chaffin MD; Precision Cardiology Laboratory (PCL), Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA. sfleming@broadinstitute.org.
Arduini A; Precision Cardiology Laboratory (PCL), Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.
Akkad AD; Cardiovascular Disease Initiative, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.
Banks E; Precision Cardiology Laboratory (PCL), Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.
Marioni JC; Bayer US, LLC, Cambridge, MA, USA.
Philippakis AA; Precision Cardiology Laboratory (PCL), Bayer US, LLC, Cambridge, MA, USA.
Ellinor PT; Data Sciences Platform, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.
Babadi M; Wellcome Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, UK.

Nat Methods ; 20(9): 1323-1335, 2023 09.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37550580

Asunto(s)

ARN Nuclear Pequeño; Programas Informáticos; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Análisis de la Célula Individual/métodos; Perfilación de la Expresión Génica/métodos

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / ARN Nuclear Pequeño Tipo de estudio: Qualitative_research Idioma: En Revista: Nat Methods Asunto de la revista: TECNICAS E PROCEDIMENTOS DE LABORATORIO Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Estados Unidos

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