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Genome Sequencing and Characterization of an Avian Orthoavulavirus 1 VG/GA-like Isolate with a Unique Fusion Cleavage Site Motif.
Kariithi, Henry M; Suarez, David L; Davis, James F; Dufour-Zavala, Louise; Olivier, Tim L; Williams-Coplin, Dawn; Bakre, Abhijeet; Lee, Chang-Won.
Afiliación
  • Kariithi HM; Exotic and Emerging Avian Viral Diseases Research Unit, Southeast Poultry Research Laboratory, U.S. National Poultry Research Center, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, Athens, GA 30605.
  • Suarez DL; Biotechnology Research Institute, Kenya Agricultural and Livestock Research Organization, Kaptagat Rd, Nairobi, Kenya.
  • Davis JF; Exotic and Emerging Avian Viral Diseases Research Unit, Southeast Poultry Research Laboratory, U.S. National Poultry Research Center, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, Athens, GA 30605.
  • Dufour-Zavala L; Georgia Poultry Laboratory Network, Gainesville, GA 30507.
  • Olivier TL; Georgia Poultry Laboratory Network, Gainesville, GA 30507.
  • Williams-Coplin D; Exotic and Emerging Avian Viral Diseases Research Unit, Southeast Poultry Research Laboratory, U.S. National Poultry Research Center, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, Athens, GA 30605.
  • Bakre A; Exotic and Emerging Avian Viral Diseases Research Unit, Southeast Poultry Research Laboratory, U.S. National Poultry Research Center, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, Athens, GA 30605.
  • Lee CW; Exotic and Emerging Avian Viral Diseases Research Unit, Southeast Poultry Research Laboratory, U.S. National Poultry Research Center, Agricultural Research Service, U.S. Department of Agriculture, Athens, GA 30605.
Avian Dis ; 67(1): 33-41, 2023 03.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37140109
RESUMEN
Secuenciación y caracterización del genoma de un aislado similar a VG/GA del ortoavulavirus aviar 1 con un motivo único en el sitio de disociación del gene de fusión. Se identificó una secuencia genómica completa de una cepa similar a la cepa Villegas-Glisson/Universidad de Georgia (VG/GA) del ortoavulavirus aviar 1 (AOAV-1) mediante secuenciación no dirigida de nueva generación de una muestra de hisopo orofaríngeo recolectada de una gallina muerta de traspatio de 12 meses. El aislado tiene un motivo en el sitio de disociación de la proteína de fusión (F) consistente con un ortoavulavirus aviar de baja virulencia, pero tiene un motivo único con fenilalanina en la posición 117 (112G-R-Q-G-R↓F117), que es típico para cepas virulentas del AOAV-1. La diferencia de un nucleótido en el sitio de escisión en comparación con otros virus de baja virulencia hizo que el aislado fuera detectable mediante transcripción reversa y PCR en tiempo real en tiempo real específica del gene F (rtRT-PCR) desarrollada como una prueba de diagnóstico para detectar específicamente a las cepas virulentas. El tiempo medio de muerte determinado en huevos y el índice de patogenicidad intracerebral determinado en pollos clasificaron al aislado como lentogénico. Este es el primer informe en los Estados Unidos de un virus lentogénico similar a VG/GA con un residuo de fenilalanina en la posición 117 del sitio de disociación de la proteína F. Además de la preocupación por el posible cambio patogénico del virus a través de cambios adicionales en el sitio de disociación, nuestro contribuye con un mayor conocimiento por parte del personal de diagnóstico acerca de posibles falsos positivos en las pruebas rtRT-PCR del gene F.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Enfermedades de las Aves de Corral / Enfermedad de Newcastle Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: Avian Dis Año: 2023 Tipo del documento: Article Pais de publicación: Estados Unidos
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