GVC: efficient random access compression for gene sequence variations.

Adhisantoso, Yeremia Gunawan; Voges, Jan; Rohlfing, Christian; Tunev, Viktor; Ohm, Jens-Rainer; Ostermann, Jörn

Adhisantoso, Yeremia Gunawan; Voges, Jan; Rohlfing, Christian; Tunev, Viktor; Ohm, Jens-Rainer; Ostermann, Jörn.

Afiliación

Adhisantoso YG; Institut für Informationsverarbeitung and L3S Research Center, Leibniz University Hannover, Hannover, Germany. adhisant@tnt.uni-hannover.de.
Voges J; Institut für Informationsverarbeitung and L3S Research Center, Leibniz University Hannover, Hannover, Germany.
Rohlfing C; Institut für Nachrichtentechnik, RWTH Aachen University, Aachen, Germany.
Tunev V; Institut für Nachrichtentechnik, RWTH Aachen University, Aachen, Germany.
Ohm JR; Institut für Nachrichtentechnik, RWTH Aachen University, Aachen, Germany.
Ostermann J; Institut für Informationsverarbeitung and L3S Research Center, Leibniz University Hannover, Hannover, Germany.

BMC Bioinformatics ; 24(1): 121, 2023 Mar 28.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-36978010

Asunto(s)

Compresión de Datos; Compresión de Datos/métodos; Algoritmos; Estudio de Asociación del Genoma Completo; Genómica/métodos; Programas Informáticos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Análisis de Secuencia de ADN/métodos

Palabras clave

Compression; Random access; VCF; Variants

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Compresión de Datos Tipo de estudio: Clinical_trials Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania Pais de publicación: Reino Unido

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