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Real-time multiplex PCR for human echinococcosis and differential diagnosis.
Knapp, Jenny; Lallemand, Séverine; Monnien, Franck; Felix, Sophie; Courquet, Sandra; Umhang, Gérald; Millon, Laurence.
Afiliación
  • Knapp J; Department of Parasitology-Mycology, National Reference Centre for Echinococcoses, University Hospital of Besançon, 25030 Besançon, France - UMR CNRS 6249 Laboratoire Chrono-environnement, University of Franche-Comté, 16 Route de Gray, 25030 Besançon, France.
  • Lallemand S; UMR CNRS 6249 Laboratoire Chrono-environnement, University of Franche-Comté, 16 Route de Gray, 25030 Besançon, France.
  • Monnien F; Department of Pathology, University Hospital of Besançon, 25030 Besançon, France.
  • Felix S; Department of Pathology, University Hospital of Besançon, 25030 Besançon, France.
  • Courquet S; Department of Parasitology-Mycology, National Reference Centre for Echinococcoses, University Hospital of Besançon, 25030 Besançon, France - UMR CNRS 6249 Laboratoire Chrono-environnement, University of Franche-Comté, 16 Route de Gray, 25030 Besançon, France.
  • Umhang G; ANSES Nancy laboratory for Rabies and Wildlife, National Reference Laboratory for Echinococcus spp., Wildlife Surveillance and Eco-epidemiology Unit, Technopole Agricole et Vétérinaire, 54220 Malzéville, France.
  • Millon L; Department of Parasitology-Mycology, National Reference Centre for Echinococcoses, University Hospital of Besançon, 25030 Besançon, France - UMR CNRS 6249 Laboratoire Chrono-environnement, University of Franche-Comté, 16 Route de Gray, 25030 Besançon, France.
Parasite ; 30: 3, 2023.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-36700708
Title: PCR multiplex en temps-réel pour le diagnostic de l'échinococcose humaine et diagnostic différentiel. Abstract: L'identification moléculaire des pathogènes infectieux humains rares semble être l'une des méthodes actuelles les plus pertinentes pour un diagnostic et une prise en charge rapides des patients. Les techniques de PCR, en particulier la PCR quantitative en temps réel, sont bien adaptées à la détection d'ADN de pathogènes, même pour de faibles concentrations. Les infections à échinocoque sont dues à des helminthes du genre Echinococcus, des espèces étroitement apparentées, impliquées dans des lésions parasitaires affectant les animaux et accidentellement l'homme. Une qPCR multiplex (MLX qPCR), permettant la détection de quatre espèces d'Echinococcus impliquées en Europe dans l'échinococcose alvéolaire (EA) et kystique (EK) (Echinococcus multilocularis, E. granulosus sensu stricto, E. ortleppi et E. canadensis), basée sur de courtes cibles mitochondriales a été développée ici. Une collection a été constituée de 81 tissus frais ou fixés en paraffine (FFPE) de lésions d'EA et EK. Les essais de qPCR ont été réalisées en triplex pour la détection d'Echinococcus spp., associés à une qPCR de contrôle d'inhibition. Une PCR duplex a été développée pour le diagnostic de deux autres helminthiases en impasse chez l'Homme (cysticercose (Taenia solium), et toxocarose (Toxocara cati et T. canis). La sensibilité de la qPCR a été évaluée et s'échelonne de 1 à 5 × 10−4 ng/µl (sept essais de qPCR positifs), correspondant à 37 à 42 cycles pour l'ADN quantifiable. La spécificité était de 100 % pour toutes les cibles. Cette qPCR multiplex, adaptée à de faibles quantités d'ADN peut être mise en œuvre au laboratoire pour un diagnostic moléculaire rapide des espèces d'Echinococcus.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Echinococcus granulosus / Echinococcus multilocularis / Equinococosis Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Parasite Asunto de la revista: PARASITOLOGIA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia Pais de publicación: Francia
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Echinococcus granulosus / Echinococcus multilocularis / Equinococosis Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Parasite Asunto de la revista: PARASITOLOGIA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia Pais de publicación: Francia