Numt Parser: Automated identification and removal of nuclear mitochondrial pseudogenes (numts) for accurate mitochondrial genome reconstruction in Panthera.

de Flamingh, Alida; Rivera-Colón, Angel G; Gnoske, Tom P; Kerbis Peterhans, Julian C; Catchen, Julian; Malhi, Ripan S; Roca, Alfred L

de Flamingh, Alida; Rivera-Colón, Angel G; Gnoske, Tom P; Kerbis Peterhans, Julian C; Catchen, Julian; Malhi, Ripan S; Roca, Alfred L.

Afiliación

de Flamingh A; Carl R. Woese Institute for Genomic Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign (UIUC), Urbana, IL, United States.
Rivera-Colón AG; Program in Ecology, Evolution and Conservation Biology, UIUC, Urbana, IL, United States.
Gnoske TP; Department of Evolution, Ecology and Behavior, UIUC, Urbana, IL, United States.
Kerbis Peterhans JC; Field Museum of Natural History (FMNH), Chicago, IL, United States.
Catchen J; Field Museum of Natural History (FMNH), Chicago, IL, United States.
Malhi RS; Science & Education, Field Museum of Natural History, Chicago, IL, United States.
Roca AL; College of Arts & Science, Roosevelt University, Chicago, IL, United States.

J Hered ; 114(2): 120-130, 2023 04 06.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-36525576

Asunto(s)

Genoma Mitocondrial; Panthera; Animales; Seudogenes; Panthera/genética; Filogenia; Reproducibilidad de los Resultados; ADN Mitocondrial/genética; Núcleo Celular/genética; Análisis de Secuencia de ADN

Palabras clave

Panthera leo melanochaitus; Cape lion; cymt; mitogenome assembly; read filter

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Panthera / Genoma Mitocondrial Tipo de estudio: Diagnostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: J Hered Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Estados Unidos

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