Identification and expression profile of odorant-binding proteins in the parasitic wasp Microplitis pallidipes using PacBio long-read sequencing.
Parasite
; 29: 53, 2022.
Article
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| MEDLINE
| ID: mdl-36350195
Title: Identification et profil d'expression des protéines de liaison aux odeurs chez la guêpe parasite Microplitis pallidipes à l'aide du séquençage à lecture longue PacBio. Abstract: Microplitis pallidipes Szépligeti (Hymenoptera : Braconidae) est une importante guêpe parasite des larves de noctuelles de deuxième et troisième stades telles que les insectes ravageurs Spodoptera exigua, Spodoptera litura et Spodoptera frugiperda. Comme d'autres insectes, M. pallidipes possède un système de reconnaissance chimiosensoriel, essentiel à la recherche de nourriture, à l'accouplement, à la ponte et à d'autres comportements. Les protéines de liaison aux odeurs (PLO) sont importantes pour le système, mais celles de M. pallidipes n'ont pas été déterminées. Cette étude a utilisé le séquençage à lecture longue PacBio pour identifier 170 980 unigènes de M. pallidipes et prédit 129 381 protéines. Après la récupération des séquences de PLO possibles, nous avons supprimé celles qui étaient redondantes ou pas de pleine longueur et avons finalement cloné cinq séquences de PLO, MpOBP2, MpOBP3, MpOBP8, MpOBP10 et MpPBP, respectivement de taille 429, 429, 459, 420 et 429 pb. Chaque PLO de M. pallidipes avait six résidus de cystéine conservés. L'analyse phylogénétique a révélé que les cinq PLO étaient situés à différentes branches de l'arbre phylogénétique. De plus, les profils d'expression tissulaire ont indiqué que MpOBP2 et MpPBP étaient principalement exprimés dans les antennes des guêpes mâles, tandis que MpOBP3, MpOBP8 et MpOBP10 étaient principalement exprimés dans les antennes des guêpes femelles. MpOBP3 était également fortement exprimé dans les pattes des guêpes femelles. Les profils temporels ont révélé que l'expression de chaque PLO de M. pallidipes culminait à différents jours après l'émergence à l'âge adulte. En conclusion, nous avons identifié cinq nouvelles protéines de liaison aux odeurs de M. pallidipes et démontré des différences biologiquement pertinentes dans les profils d'expression.
Palabras clave
Texto completo:
1
Colección:
01-internacional
Base de datos:
MEDLINE
Asunto principal:
Avispas
Tipo de estudio:
Diagnostic_studies
Límite:
Animals
Idioma:
En
Revista:
Parasite
Asunto de la revista:
PARASITOLOGIA
Año:
2022
Tipo del documento:
Article
País de afiliación:
China
Pais de publicación:
Francia