Comparison of molecular diagnostic approaches for the detection and differentiation of the intestinal protist Blastocystis sp. in humans.
Parasite
; 29: 30, 2022.
Article
en En
| MEDLINE
| ID: mdl-35638752
Title: Comparaison des approches de diagnostic moléculaire pour la détection et la différenciation du protiste intestinal Blastocystis sp. chez l'homme. Abstract: Blastocystis est le protiste intestinal le plus répandu dans le monde. La détection et la différenciation précises de Blastocystis, y compris ses sous-types (sans doute des espèces), sont essentielles pour comprendre son épidémiologie et son rôle dans la santé humaine. Nous avons comparé (i) la sensibilité de la PCR conventionnelle (cPCR) et de la qPCR dans un ensemble de 288 échantillons d'ADN obtenus à partir d'échantillons de selles d'individus en bonne santé intestinale et (ii) la diversité des sous-types détectée par le séquençage de nouvelle génération (NGS) par rapport au séquençage Sanger. La PCR en temps réel a donné plus d'échantillons positifs que la cPCR, révélant une charge fécale élevée de Blastocystis sur la base de la courbe de quantification dans la plupart des échantillons. Dans la détection des sous-types, le NGS était largement en accord avec le séquençage de Sanger mais a montré une sensibilité plus élevée pour la colonisation de sous-types mixtes au sein d'un hôte. Ce fait, associé à l'utilisation de la combinaison de qPCR et de NGS et à l'obtention d'informations sur la charge fécale de protistes, sera bénéfique pour les études épidémiologiques et de surveillance.
Palabras clave
Texto completo:
1
Colección:
01-internacional
Base de datos:
MEDLINE
Asunto principal:
Infecciones por Blastocystis
/
Blastocystis
Tipo de estudio:
Diagnostic_studies
Límite:
Humans
Idioma:
En
Revista:
Parasite
Asunto de la revista:
PARASITOLOGIA
Año:
2022
Tipo del documento:
Article
País de afiliación:
República Checa
Pais de publicación:
Francia