Beware to ignore the rare: how imputing zero-values can improve the quality of 16S rRNA gene studies results.

Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; Di Camillo, Barbara

Baruzzo, Giacomo; Patuzzi, Ilaria; Di Camillo, Barbara.

Afiliación

Baruzzo G; Department of Information Engineering, University of Padova, Padua, Italy.
Patuzzi I; Department of Information Engineering, University of Padova, Padua, Italy.
Di Camillo B; Microbial Ecology Unit, Istituto Zooprofilattico Sperimentale Delle Venezie, Padua, Italy.

BMC Bioinformatics ; 22(Suppl 15): 618, 2022 Feb 07.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35130833

Asunto(s)

Bacterias; Análisis de Datos; Bacterias/genética; Genes de ARNr; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; ARN Ribosómico 16S/genética; Análisis de Secuencia de ADN

Palabras clave

16S rDNA-Seq; Benchmarking; Count data; Count preprocessing; Count simulation; Normalization; Sparsity; Zero-imputation

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Bacterias / Análisis de Datos Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: Italia Pais de publicación: Reino Unido

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