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PCR system for the correct differentiation of the main bacterial species of the Klebsiella pneumoniae complex.
Barrios-Camacho, Humberto; Silva-Sánchez, Jesús; Cercas-Ayala, Elena; Lozano-Aguirre, Luis; Duran-Bedolla, Josefina; Aguilar-Vera, Alejandro; Garza-González, Elvira; Bocanegra-Ibarias, Paola; Morfín-Otero, Rayo; Hernández-Castro, Rigoberto; Garza-Ramos, Ulises.
Afiliación
  • Barrios-Camacho H; Centro de Investigación Sobre Enfermedades Infecciosas (CISEI), Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Instituto Nacional de Salud Pública (INSP), Av. Universidad # 655, Col. Sta. Ma. Ahuacatitlán, C.P. 62100, Cuernavaca, Morelos, Mexico.
  • Silva-Sánchez J; Centro de Investigación Sobre Enfermedades Infecciosas (CISEI), Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Instituto Nacional de Salud Pública (INSP), Av. Universidad # 655, Col. Sta. Ma. Ahuacatitlán, C.P. 62100, Cuernavaca, Morelos, Mexico.
  • Cercas-Ayala E; Centro de Investigación Sobre Enfermedades Infecciosas (CISEI), Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Instituto Nacional de Salud Pública (INSP), Av. Universidad # 655, Col. Sta. Ma. Ahuacatitlán, C.P. 62100, Cuernavaca, Morelos, Mexico.
  • Lozano-Aguirre L; Programa de Genómica Evolutiva, Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico.
  • Duran-Bedolla J; Centro de Investigación Sobre Enfermedades Infecciosas (CISEI), Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Instituto Nacional de Salud Pública (INSP), Av. Universidad # 655, Col. Sta. Ma. Ahuacatitlán, C.P. 62100, Cuernavaca, Morelos, Mexico.
  • Aguilar-Vera A; Programa de Genómica Funcional de Procariotes, Centro de Ciencias Genómicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico.
  • Garza-González E; Hospital Universitario Dr. José Eleuterio González, Universidad Autónoma de Nuevo León, Monterrey, Nuevo León, Mexico.
  • Bocanegra-Ibarias P; Hospital Universitario Dr. José Eleuterio González, Universidad Autónoma de Nuevo León, Monterrey, Nuevo León, Mexico.
  • Morfín-Otero R; Hospital Civil de Guadalajara Fray Antonio Alcalde, Universidad de Guadalajara, Guadalajara, Jalisco, Mexico.
  • Hernández-Castro R; Departamento de Agentes Patógenos, Hospital General "Dr. Manuel Gea González", Mexico City, Mexico.
  • Garza-Ramos U; Centro de Investigación Sobre Enfermedades Infecciosas (CISEI), Laboratorio de Resistencia Bacteriana, Instituto Nacional de Salud Pública (INSP), Av. Universidad # 655, Col. Sta. Ma. Ahuacatitlán, C.P. 62100, Cuernavaca, Morelos, Mexico. ulises.garza@insp.mx.
Arch Microbiol ; 204(1): 73, 2021 Dec 24.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34951665
Accurate recognition of the closely related species Klebsiella pneumoniae, Klebsiella quasipneumoniae and Klebsiella variicola by phenotypic, biochemical and automated tests is notoriously unreliable in hospitals' diagnostic laboratories. A comparative genomics approach was conducted for the correct differentiation of the main bacterial species in the K. pneumoniae complex. Analysis of the deduced proteomes of 87 unique genomes of the Klebsiella in public databases, was used for the identification of unique protein family members. This allowed the design of a multiplex-PCR assay for the correct differentiation of these three species from different origins. This system allowed us to determine the prevalence of K. pneumoniae, K. quasipneumoniae and K. variicola among a collection of 552 clinical isolates. Of these, 87.3% (482/552) isolates corresponded to K. pneumoniae, 6.7% (33/552) to K. quasipneumoniae and 5.9% (33/552) to K. variicola. The multiplex-PCR results showed a 100% accuracy for the correct identification of the three species evaluated, which was validated with rpoB phylogenetic sequence analysis.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Infecciones por Klebsiella / Klebsiella pneumoniae Tipo de estudio: Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Arch Microbiol Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: México Pais de publicación: Alemania
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Infecciones por Klebsiella / Klebsiella pneumoniae Tipo de estudio: Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Arch Microbiol Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: México Pais de publicación: Alemania