[Comparative genomic analysis: from SARS to SARS-CoV-2 virus-types. Similarities and differences]. / Análisis de genómica comparativa: del virus SARS al SARS-CoV-2. Similitudes y diferencias.
Rev Med Inst Mex Seguro Soc
; 58(Supl 2): S121-133, 2020 09 21.
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| ID: mdl-34695325
RESUMEN
INTRODUCCIÓN: en este momento somos testigos de un evento de magnitud mundial provocado por el brote pandémico derivado del nuevo virus SARS-CoV-2, lo cual requiere la generación de conocimiento. Por lo novedoso que resulta, muchas hipótesis y teorías son discutidas a diario respecto al origen de este nuevo virus. Varios estudios están enfocados en demostrar la similitud que el SARS-CoV-2 tiene con otros virus. OBJETIVO: resaltar las diferencias del SARS-CoV-2 con otros virus SARS, a partir de un análisis de genómica comparativa, y determinar si se pueden atribuir a eventos de manipulación. MATERIAL Y MÉTODOS: se descargaron dos genomas completos de virus SARS, seis genomas completos de coronavirus humanos y 16 de coronavirus tipo SARS; fueron analizados en un estudio de genómica comparativa mediante la herramienta BLAST Ring Image Generator, y a continuación se examinaron las diferencias evidentes mediante el uso de los programas MAFFT y BLAST. RESULTADOS: se observó una alta identidad en fragmentos de los genomas tipo SARS de mamíferos con los genomas SARS-CoV-1 y SARS-CoV-2, y se identificaron tres diferencias nucleotídicas principales: en el gen ORF1ab región nsp3, en el gen S de reconocimiento al receptor y en el gen ORF8, con el cual se pueden separar las cepas tipo SARS de mamíferos en tipo SARS-CoV-1 y SARS-CoV-2. CONCLUSIÓN: el genoma completo de SARS-CoV-2 posee una alta identidad con cepas tipo SARS de mamíferos, por lo que su aparición más probable podría ser el resultado de la evolución natural.
Texto completo:
1
Colección:
01-internacional
Base de datos:
MEDLINE
Idioma:
Es
Revista:
Rev Med Inst Mex Seguro Soc
Asunto de la revista:
MEDICINA
/
MEDICINA SOCIAL
Año:
2020
Tipo del documento:
Article
Pais de publicación:
México