Immune cell deconvolution of bulk DNA methylation data reveals an association with methylation class, key somatic alterations, and cell state in glial/glioneuronal tumors.

Singh, Omkar; Pratt, Drew; Aldape, Kenneth

Singh, Omkar; Pratt, Drew; Aldape, Kenneth.

Afiliación

Singh O; Laboratory of Pathology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 20892, USA.
Pratt D; Laboratory of Pathology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 20892, USA.
Aldape K; Department of Pathology, University of Michigan, Ann Arbor, MI, 48109, USA.

Acta Neuropathol Commun ; 9(1): 148, 2021 09 08.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34496929

Asunto(s)

Biomarcadores de Tumor/inmunología; Neoplasias Encefálicas/inmunología; Metilación de ADN/fisiología; Glioma/inmunología; Inmunidad Celular/fisiología; Microambiente Tumoral/fisiología; Biomarcadores de Tumor/genética; Biomarcadores de Tumor/metabolismo; Neoplasias Encefálicas/metabolismo; Neoplasias Encefálicas/patología; Estudios de Cohortes; Variaciones en el Número de Copia de ADN/fisiología; Análisis de Datos; Glioma/genética; Glioma/metabolismo; Humanos; Monocitos/inmunología; Monocitos/metabolismo

Palabras clave

Deconvolution; Genomic aberrations; Immunotherapy; Tumor microenvironment

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Neoplasias Encefálicas / Biomarcadores de Tumor / Metilación de ADN / Microambiente Tumoral / Glioma / Inmunidad Celular Tipo de estudio: Etiology_studies / Incidence_studies / Observational_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Acta Neuropathol Commun Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido

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