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A host transcriptomic signature for identification of respiratory viral infections in the community.
Almansa, Raquel; Herrero-Rodríguez, Carmen; Martínez-Huélamo, Misericordia; Vicente-Andres, Maria Del Pilar; Nieto-Barbero, Jose Angel; Martín-Ballesteros, Miryam; Rodilla-Carvajal, Maria Del Mar; de la Fuente, Amanda; Ortega, Alicia; Alonso-Ramos, Maria Jesus; Wacker, James; Liesenfeld, Oliver; Sweeney, Timothy E; Bermejo-Martin, Jesús F; García-Ortiz, Luis.
Afiliación
  • Almansa R; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain.
  • Herrero-Rodríguez C; Hospital Universitario Río Hortega, Gerencia Regional de Salud, Valladolid, Spain.
  • Martínez-Huélamo M; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Respiratorias (CIBERES), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain.
  • Vicente-Andres MDP; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.
  • Nieto-Barbero JA; Unidad de Investigación en Atención Primaria de Salamanca (APISAL), Instituto de investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.
  • Martín-Ballesteros M; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.
  • Rodilla-Carvajal MDM; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.
  • de la Fuente A; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.
  • Ortega A; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.
  • Alonso-Ramos MJ; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.
  • Wacker J; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain.
  • Liesenfeld O; Hospital Universitario Río Hortega, Gerencia Regional de Salud, Valladolid, Spain.
  • Sweeney TE; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain.
  • Bermejo-Martin JF; Hospital Universitario Río Hortega, Gerencia Regional de Salud, Valladolid, Spain.
  • García-Ortiz L; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain.
Eur J Clin Invest ; 51(12): e13626, 2021 Dec.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34120332
BACKGROUND: Fever-7 is a test evaluating host mRNA expression levels of IFI27, JUP, LAX, HK3, TNIP1, GPAA1 and CTSB in blood able to detect viral infections. This test has been validated mostly in hospital settings. Here we have evaluated Fever-7 to identify the presence of respiratory viral infections in a Community Health Center. METHODS: A prospective study was conducted in the "Servicio de Urgencias de Atención Primaria" in Salamanca, Spain. Patients with clinical signs of respiratory infection and at least one point in the National Early Warning Score were recruited. Fever-7 mRNAs were profiled on a Nanostring nCounter® SPRINT instrument from blood collected upon patient enrolment. Viral diagnosis was performed on nasopharyngeal aspirates (NPAs) using the Biofire-RP2 panel. RESULTS: A respiratory virus was detected in the NPAs of 66 of the 100 patients enrolled. Median National Early Warning Score was 7 in the group with no virus detected and 6.5 in the group with a respiratory viral infection (P > .05). The Fever-7 score yielded an overall AUC of 0.81 to predict a positive viral syndromic test. The optimal operating point for the Fever-7 score yielded a sensitivity of 82% with a specificity of 71%. Multivariate analysis showed that Fever-7 was a robust marker of viral infection independently of age, sex, major comorbidities and disease severity at presentation (OR [CI95%], 3.73 [2.14-6.51], P < .001). CONCLUSIONS: Fever-7 is a promising host immune mRNA signature for the early identification of a respiratory viral infection in the community.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Infecciones del Sistema Respiratorio / Virosis / ARN Mensajero Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Observational_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Aged / Aged80 / Female / Humans / Male Idioma: En Revista: Eur J Clin Invest Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: España Pais de publicación: Reino Unido
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Infecciones del Sistema Respiratorio / Virosis / ARN Mensajero Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Observational_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Aged / Aged80 / Female / Humans / Male Idioma: En Revista: Eur J Clin Invest Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: España Pais de publicación: Reino Unido