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Cell segmentation-free inference of cell types from in situ transcriptomics data.
Park, Jeongbin; Choi, Wonyl; Tiesmeyer, Sebastian; Long, Brian; Borm, Lars E; Garren, Emma; Nguyen, Thuc Nghi; Tasic, Bosiljka; Codeluppi, Simone; Graf, Tobias; Schlesner, Matthias; Stegle, Oliver; Eils, Roland; Ishaque, Naveed.
Afiliación
  • Park J; Berlin Institute of Health at Charité - Universitätsmedizin Berlin, Digital Health Center, Kapelle-Ufer 2, 10117, Berlin, Germany.
  • Choi W; Faculty of Biosciences, Heidelberg University, Heidelberg, Germany.
  • Tiesmeyer S; Division of Computational Genomics and System Genetics, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany.
  • Long B; Department of Computer Science, Boston University, Boston, MA, USA.
  • Borm LE; Berlin Institute of Health at Charité - Universitätsmedizin Berlin, Digital Health Center, Kapelle-Ufer 2, 10117, Berlin, Germany.
  • Garren E; Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA.
  • Nguyen TN; Division of molecular neurobiology, Department of medical biochemistry and biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
  • Tasic B; Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA.
  • Codeluppi S; Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA.
  • Graf T; Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA.
  • Schlesner M; Division of molecular neurobiology, Department of medical biochemistry and biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
  • Stegle O; Berlin Institute of Health at Charité - Universitätsmedizin Berlin, Digital Health Center, Kapelle-Ufer 2, 10117, Berlin, Germany.
  • Eils R; Bioinformatics and Omics Data Analytics, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany.
  • Ishaque N; Division of Computational Genomics and System Genetics, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany.
Nat Commun ; 12(1): 3545, 2021 06 10.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34112806
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Procesamiento de Imagen Asistido por Computador / Encéfalo / Hibridación Fluorescente in Situ / Biología Computacional / Perfilación de la Expresión Génica / Imagenología Tridimensional / Análisis de la Célula Individual Límite: Animals Idioma: En Revista: Nat Commun Asunto de la revista: BIOLOGIA / CIENCIA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania Pais de publicación: Reino Unido
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Procesamiento de Imagen Asistido por Computador / Encéfalo / Hibridación Fluorescente in Situ / Biología Computacional / Perfilación de la Expresión Génica / Imagenología Tridimensional / Análisis de la Célula Individual Límite: Animals Idioma: En Revista: Nat Commun Asunto de la revista: BIOLOGIA / CIENCIA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania Pais de publicación: Reino Unido