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Transcriptome Analyses Throughout Chili Pepper Fruit Development Reveal Novel Insights into the Domestication Process.
Martínez, Octavio; Arce-Rodríguez, Magda L; Hernández-Godínez, Fernando; Escoto-Sandoval, Christian; Cervantes-Hernández, Felipe; Hayano-Kanashiro, Corina; Ordaz-Ortiz, José J; Reyes-Valdés, M Humberto; Razo-Mendivil, Fernando G; Garcés-Claver, Ana; Ochoa-Alejo, Neftalí.
Afiliación
  • Martínez O; Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav), Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Irapuato, Guanajuato 36824, Mexico.
  • Arce-Rodríguez ML; Departamento de Ingeniería Genética, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav), Irapuato, Guanajuato 36824, Mexico.
  • Hernández-Godínez F; Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav), Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Irapuato, Guanajuato 36824, Mexico.
  • Escoto-Sandoval C; Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav), Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Irapuato, Guanajuato 36824, Mexico.
  • Cervantes-Hernández F; Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav), Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Irapuato, Guanajuato 36824, Mexico.
  • Hayano-Kanashiro C; Departamento de Investigaciones Científicas y Tecnológicas de la Universidad de Sonora, Universidad de Sonora, Hermosillo, Sonora 83000, Mexico.
  • Ordaz-Ortiz JJ; Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav), Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Irapuato, Guanajuato 36824, Mexico.
  • Reyes-Valdés MH; Department of Plant Breeding, Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro, Saltillo, Coahuila 25315, Mexico.
  • Razo-Mendivil FG; Departamento de Investigaciones Científicas y Tecnológicas de la Universidad de Sonora, Universidad de Sonora, Hermosillo, Sonora 83000, Mexico.
  • Garcés-Claver A; Unidad de Hortofruticultura, Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón, Instituto Agroalimentario de Aragón-IA2 (CITA-Universidad de Zaragoza), 50059 Zaragoza, Spain.
  • Ochoa-Alejo N; Departamento de Ingeniería Genética, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (Cinvestav), Irapuato, Guanajuato 36824, Mexico.
Plants (Basel) ; 10(3)2021 Mar 19.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33808668
Chili pepper (Capsicum spp.) is an important crop, as well as a model for fruit development studies and domestication. Here, we performed a time-course experiment to estimate standardized gene expression profiles with respect to fruit development for six domesticated and four wild chili pepper ancestors. We sampled the transcriptomes every 10 days from flowering to fruit maturity, and found that the mean standardized expression profiles for domesticated and wild accessions significantly differed. The mean standardized expression was higher and peaked earlier for domesticated vs. wild genotypes, particularly for genes involved in the cell cycle that ultimately control fruit size. We postulate that these gene expression changes are driven by selection pressures during domestication and show a robust network of cell cycle genes with a time shift in expression, which explains some of the differences between domesticated and wild phenotypes.
Palabras clave

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Idioma: En Revista: Plants (Basel) Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: México Pais de publicación: Suiza

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Idioma: En Revista: Plants (Basel) Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: México Pais de publicación: Suiza