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Short Communication: Update in Natural Antiretroviral Resistance-Associated Mutations Among HIV Type 2 Variants and Discrepancies Across HIV Type 2 Resistance Interpretation Tools.
Troyano-Hernáez, Paloma; Reinosa, Roberto; Burgos, María Concepción; Holguín, África.
Afiliación
  • Troyano-Hernáez P; HIV-1 Molecular Epidemiology Laboratory, Department of Microbiology and Parasitology, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Hospital Universitario Ramón y Cajal, CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Red en Investigación Translacional en Infecciones Pediátricas (R
  • Reinosa R; HIV-1 Molecular Epidemiology Laboratory, Department of Microbiology and Parasitology, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Hospital Universitario Ramón y Cajal, CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Red en Investigación Translacional en Infecciones Pediátricas (R
  • Burgos MC; HIV-1 Molecular Epidemiology Laboratory, Department of Microbiology and Parasitology, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Hospital Universitario Ramón y Cajal, CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Red en Investigación Translacional en Infecciones Pediátricas (R
  • Holguín Á; HIV-1 Molecular Epidemiology Laboratory, Department of Microbiology and Parasitology, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Hospital Universitario Ramón y Cajal, CIBER en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Red en Investigación Translacional en Infecciones Pediátricas (R
AIDS Res Hum Retroviruses ; 37(10): 793-795, 2021 10.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33586996
HIV variants carry natural polymorphisms related to drug resistance (R-markers) fixed during viral evolution in the absence of antiretroviral therapy (ART) that may impact on drug susceptibility and resistance pathways. We aimed to identify the HIV type 2 (HIV-2) variant-specific R-markers at Pol in all available sequences from ART-naive subjects deposited in Los Alamos database according to reported HIV-2 drug resistance-associated mutations (DRMs) and report the performance of two online HIV-2 resistance interpretation tools (HIV2EU Tool and Stanford HIVdb Program for HIV-2) to detect them. From a total of 587 sequences, we found 23 R-markers in low frequency, in groups A, B, and G. Four were present in >10% of the sequences with no direct impact on antiretroviral susceptibility. HIV2EU Tool detected one, whereas Stanford program all four. Stanford new tool, although still under development, seems effective in detecting HIV-2 DRMs and may prove a useful tool for HIV-2 resistance interpretation when fully developed.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: VIH-2 / Fármacos Anti-VIH / Farmacorresistencia Viral Tipo de estudio: Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: AIDS Res Hum Retroviruses Asunto de la revista: SINDROME DA IMUNODEFICIENCIA ADQUIRIDA (AIDS) Año: 2021 Tipo del documento: Article Pais de publicación: Estados Unidos
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