Integration of anatomy ontology data with protein-protein interaction networks improves the candidate gene prediction accuracy for anatomical entities.

Fernando, Pasan C; Mabee, Paula M; Zeng, Erliang

Fernando, Pasan C; Mabee, Paula M; Zeng, Erliang.

Afiliación

Fernando PC; Department of Biology, University of South Dakota, Vermillion, SD, USA. pasanfernando87@gmail.com.
Mabee PM; Department of Biology, University of South Dakota, Vermillion, SD, USA.
Zeng E; National Ecological Observatory Network, Battelle Memorial Institute, 1685 38th St., Suite 100, Boulder, CO, 80301, USA.

BMC Bioinformatics ; 21(1): 442, 2020 Oct 07.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33028186

Asunto(s)

Mapeo de Interacción de Proteínas/métodos; Mapas de Interacción de Proteínas; Animales; Área Bajo la Curva; Bases de Datos de Proteínas; Redes Reguladoras de Genes; Ratones; Fenotipo; Curva ROC; Interfaz Usuario-Computador; Pez Cebra/metabolismo

Palabras clave

Anatomy ontology; Big data; Candidate gene prediction; Data integration; Data quality; Phenotype; Proteinprotein interaction networks; Semantic similarity; Uberon

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Mapeo de Interacción de Proteínas / Mapas de Interacción de Proteínas Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido

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